Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  86  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25613006--25613312
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1
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2.0
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2
144
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20
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2.2
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25662126--25662202
31
2.6
30
72
10
77
44
5
6
44
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
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1.9
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2.3
21
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1
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0
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2.4
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2
2
64
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1.9
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2.1
31
85
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46
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1.9
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16
1.05
25760510--25760702
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2.0
65
100
0
262
29
12
25
32
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
32
1.92
25760575--25760702
57
2.2
57
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186
28
12
25
32
1.92
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2.4
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1.96
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17
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19
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22
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11
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27
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48
1
1
48
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25879417--25879565
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3.7
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26
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24
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1.98
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97
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5
257
29
20
27
22
1.99
25897364--25897541
49
3.7
48
80
6
200
29
20
26
23
1.99
25904055--25904104
21
2.4
22
80
12
61
50
0
0
50
1.00
25905241--25905313
30
2.5
30
86
6
96
41
8
4
46
1.53
25909977--25910035
30
2.0
30
96
0
109
15
25
30
28
1.96
25912635--25912691
24
2.3
24
82
8
62
75
1
5
17
1.07
25917615--25917668
18
2.9
18
78
13
56
72
1
3
22
1.10
25919741--25919908
40
4.2
40
86
0
239
22
22
28
26
1.99
25920148--25920192
22
2.0
22
87
8
65
33
8
13
44
1.75
25925252--25925292
16
2.3
18
84
12
50
4
14
2
78
1.03
25928727--25929045
49
6.7
46
73
10
196
21
26
21
30
1.99
25928828--25929048
95
2.4
94
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7
281
22
27
21
28
1.99
25936472--25936578
55
1.9
55
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0
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14
28
28
28
1.95
25939504--25939562
30
2.0
30
83
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0
6
30
1.21
25944302--25944330
15
1.9
15
100
0
58
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27
34
1.83
25955102--25955158
30
1.9
30
92
0
96
38
21
15
24
1.92
25957228--25957322
49
1.9
49
89
0
145
45
8
15
30
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25959209--25959243
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1.9
18
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0
52
42
0
0
57
0.99
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16
2.0
16
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0
55
40
40
6
12
1.68
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22
2.1
23
84
3
62
72
0
4
22
1.01
25973538--25973575
19
2.1
18
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14
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28
10
0
60
1.30
25985932--25986105
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2.5
70
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5
212
29
14
22
33
1.94
25986123--25986457
74
4.5
74
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4
446
31
15
20
32
1.94
25986109--25986452
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2.3
146
84
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453
31
15
19
34
1.93
25986342--25986706
127
2.8
127
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364
26
15
22
35
1.94
25986679--25986924
88
2.8
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4
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28
17
19
34
1.94
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3.5
72
91
4
400
32
17
19
30
1.95
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16
2.0
16
93
0
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40
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12
1.68
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22
2.1
23
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72
2
4
20
1.11
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1.9
21
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10
64
27
10
0
62
1.27
25989027--25989079
21
2.3
24
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21
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28
7
1
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1.33
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32
2.1
33
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4
1
37
1.29
25995451--25995478
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5
100
0
56
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0
0
21
0.75
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2.0
20
84
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51
23
7
0
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1.16
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12
2.9
12
91
8
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22
0
0
77
0.78
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18
3.0
17
74
17
54
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5
1
26
1.25
26007128--26007183
19
2.9
19
75
17
62
66
3
0
30
1.09
26009923--26009956
2
17.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
26012915--26012948
17
2.1
17
88
5
52
41
11
2
44
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26017958--26017997
3
13.3
3
100
0
80
32
0
0
67
0.91
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22
2.0
22
86
13
63
20
20
39
18
1.93
26020830--26021101
47
5.8
49
78
9
239
23
30
19
26
1.98
26021690--26021728
18
2.2
18
100
0
78
64
12
5
17
1.46
26029690--26029909
79
2.8
79
80
6
205
26
27
20
24
1.99
26029727--26029909
40
4.6
40
80
8
187
27
27
20
24
1.99
26037591--26037810
79
2.8
79
80
6
205
26
27
20
24
1.99
26037628--26037810
40
4.6
40
80
8
187
27
27
20
24
1.99
26039613--26039739
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2.1
61
98
0
245
38
12
5
43
1.66
26047717--26047762
21
2.3
20
78
14
51
45
17
6
30
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349