Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  347  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114522969--114523002
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0
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0
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2.0
17
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0
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0
5
1.26
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4
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0
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27
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2.2
22
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3
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21
19
38
21
1.94
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0
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2.2
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0
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16
32
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32
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2.5
130
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19
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130
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2.5
20
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64
18
0
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2.5
35
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2.7
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39
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10.7
7
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2
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23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
27
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18
2
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1.9
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42
1.65
114577899--114578044
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4.8
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5
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0
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114596029--114596070
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1.9
22
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0
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0
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0
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2.0
131
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497
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10
28
33
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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35
25
2
1.68
114624001--114624060
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2.2
27
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1
1.63
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5.5
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1.9
28
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35
11
14
38
1.82
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2.2
28
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14
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1.80
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2.3
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18
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2.4
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84
6
69
58
0
1
40
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114701055--114701112
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3.1
19
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56
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1.30
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2.0
29
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21
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1.71
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0
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0
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16
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18
88
11
52
42
0
3
54
1.15
114708253--114708292
20
2.0
21
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55
52
2
0
45
1.14
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14
2.9
15
78
10
50
68
9
4
17
1.35
114710322--114710365
15
2.9
15
86
3
52
56
2
0
40
1.11
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21
2.0
21
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0
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4
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114718114--114718188
31
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0
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114718812--114718864
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0
3
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15
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6
45
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0
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0
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11
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114722679--114722730
24
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24
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0
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1
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30
1.9
30
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0
1
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0
0
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2
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43
2.5
43
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155
30
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1.97
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3
2
26
1.19
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3.0
60
73
16
170
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1
2
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1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
25
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0
1
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1.09
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15
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0
0
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3.3
22
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22
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2
0
53
1.15
114756583--114756767
41
4.6
40
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129
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2
2
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1.27
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1
0
52
1.14
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0
104
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2.0
20
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10
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2.0
95
93
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148
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2.0
21
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0
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21
29
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0
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2.0
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0
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2.0
146
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16
24
1.93
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114
2.0
109
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18
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2.2
154
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22
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14
2.1
14
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51
37
0
10
51
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
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40
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2.7
39
96
0
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0
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2.2
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0
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3.0
47
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2
178
22
22
14
41
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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