Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  229  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75418870--75419039
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40
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0
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3
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27
21
25
1.99
75418870--75419092
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4
279
26
27
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1.99
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1.9
41
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10
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25
28
21
24
1.99
75425876--75426045
40
4.3
40
93
0
252
26
27
20
25
1.99
75425876--75426098
40
5.6
39
87
3
250
26
27
21
25
1.99
75425876--75426098
120
1.9
119
82
4
279
26
27
21
25
1.99
75426030--75426107
40
1.9
41
82
10
97
25
28
21
24
1.99
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0
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2.9
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2.0
44
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3
10
39
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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117
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15
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10
171
33
24
15
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1.95
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2.3
124
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1.96
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174
30
26
18
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134
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0
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25
5
36
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
21
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52
5
2
40
1.37
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2.1
34
100
0
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1.86
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5.2
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250
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1
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30
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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86
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1.83
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1.85
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2.8
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2
267
39
22
8
28
1.84
75602551--75602775
27
8.3
27
85
3
283
36
16
20
26
1.94
75602364--75602600
81
2.9
80
80
6
253
39
21
10
28
1.87
75602982--75603051
25
2.8
25
95
0
122
28
25
20
25
1.99
75602982--75603076
50
1.9
50
80
8
113
30
24
21
24
1.99
75618109--75618140
13
2.5
13
94
0
55
15
6
28
50
1.68
75620560--75620635
35
2.2
35
85
0
98
23
22
23
30
1.99
75624411--75624446
16
2.2
16
95
0
63
58
11
8
22
1.59
75625165--75625257
44
2.1
44
89
0
150
33
21
8
36
1.84
75645761--75645818
21
2.8
21
78
5
73
24
24
37
13
1.91
75647130--75647360
48
4.8
48
80
5
252
25
29
20
24
1.99
75647130--75647365
96
2.5
96
88
1
339
25
30
19
24
1.98
75652960--75653121
42
3.8
44
76
11
133
22
19
25
32
1.97
75653560--75653587
10
2.8
10
100
0
56
17
10
21
50
1.77
75662603--75662642
21
2.0
21
90
5
64
20
27
40
12
1.88
75663796--75664007
46
4.6
46
71
15
127
24
30
18
27
1.98
75669984--75670547
47
11.6
47
90
4
795
29
28
8
34
1.86
75669984--75670547
143
3.9
143
90
3
844
29
28
8
34
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75669984--75670547
96
5.8
100
88
5
735
29
28
8
34
1.86
75670268--75670546
105
2.8
104
86
7
294
30
27
7
34
1.84
75674416--75674681
40
6.7
40
92
0
424
25
29
22
22
1.99
75676098--75676661
47
11.7
49
87
5
760
29
28
7
34
1.86
75676098--75676661
143
3.9
143
89
3
799
29
28
7
34
1.86
75676098--75676661
96
5.8
100
87
7
699
29
28
7
34
1.86
75676382--75676660
105
2.8
102
87
6
319
30
27
7
34
1.84
75688675--75688846
67
2.6
66
81
7
170
31
16
29
22
1.96
75688699--75688882
67
2.8
64
78
8
203
28
16
30
23
1.96
75690698--75690830
47
2.9
45
77
11
126
24
30
19
24
1.98
75700562--75700780
39
5.6
40
85
9
258
26
21
27
24
2.00
75700562--75700780
79
2.8
80
82
11
263
26
21
27
24
2.00
75700610--75700813
79
2.6
79
83
8
213
26
21
27
24
1.99
75703571--75703668
44
2.3
42
86
8
135
22
20
26
30
1.98
75706082--75706193
29
3.9
30
77
8
117
26
32
15
25
1.95
75706089--75706199
58
1.9
57
83
5
143
27
31
14
27
1.95
75706274--75706319
19
2.5
19
85
3
67
19
36
15
28
1.92
75711976--75712223
25
10.0
25
78
3
214
25
18
22
33
1.97
75712041--75712085
14
3.4
14
76
17
51
20
17
22
40
1.92
75711982--75712223
74
3.3
73
82
6
274
24
18
23
33
1.97
75716060--75716108
22
2.2
22
88
0
71
44
6
20
28
1.75
75719580--75719627
12
4.0
11
79
15
51
72
0
6
20
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75719580--75719627
24
2.0
25
87
4
71
72
0
6
20
1.05
75727171--75727353
79
2.3
81
83
7
223
25
28
22
23
1.99
75727150--75727353
40
5.1
39
78
11
200
25
28
22
24
1.99
75728481--75728600
56
2.1
56
98
0
231
22
23
9
45
1.81
75843815--75843999
40
4.6
40
83
8
232
23
23
27
25
2.00
75843819--75843999
83
2.2
80
90
3
274
22
23
28
25
2.00
75846297--75846994
48
14.7
48
92
3
1101
34
6
28
30
1.82
75847144--75847246
37
2.8
37
93
0
170
24
21
31
23
1.99
75849016--75849239
40
5.7
40
84
5
249
25
20
28
26
1.99
75849090--75849272
79
2.3
80
84
1
235
26
20
27
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349