Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  260  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86437268--86437378
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0
0
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17
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1.8
100
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0
100
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3.5
40
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18
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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0
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45
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15
51
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26
0
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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125
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16
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0
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3.6
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1.08
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1.14
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2
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1.37
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24
2.0
24
84
4
62
61
0
2
36
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86603626--86603659
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0
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2
2
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1.26
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0
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47
0
2
50
1.15
86617111--86617137
14
1.9
14
100
0
54
25
0
0
74
0.83
86622012--86622081
28
2.6
27
83
2
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31
8
8
51
1.63
86625414--86625445
15
2.1
16
94
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57
71
0
15
12
1.14
86631997--86632039
22
1.9
23
90
4
70
23
53
2
20
1.57
86632247--86632299
27
2.0
27
88
0
79
30
15
16
37
1.90
86641268--86641362
15
6.5
15
71
16
67
6
31
2
60
1.34
86642752--86642813
30
2.1
30
100
0
124
51
0
12
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1.40
86643230--86643263
18
1.9
17
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5
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50
8
0
41
1.34
86644883--86644933
18
2.8
18
74
14
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66
5
3
23
1.30
86647334--86648131
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4.5
176
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3
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28
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31
1.96
86647774--86647855
43
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43
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0
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1.88
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49
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14
19
20
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1.86
86649278--86649507
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95
91
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374
14
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20
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86660651--86660701
18
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18
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5
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23
1.30
86663160--86663187
6
4.7
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100
0
56
17
0
32
50
1.47
86663573--86663615
20
2.2
20
95
0
77
20
9
27
41
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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0
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9
18
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66
1.40
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20
2.9
20
87
10
73
26
3
1
67
1.16
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22
2.0
22
100
0
86
27
6
4
60
1.43
86666562--86666636
23
3.2
23
75
18
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28
9
9
53
1.64
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110
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110
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1.97
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13
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13
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1.84
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16
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29
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19
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1.96
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21
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110
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14
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0
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6
16
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2.3
14
100
0
64
6
15
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1.71
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20
2.2
20
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0
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1.57
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126
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1.96
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2.0
31
100
0
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20
1.94
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48
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306
24
27
18
29
1.98
86706909--86707286
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3.9
96
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2
445
25
26
18
28
1.98
86710207--86710384
27
6.6
27
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205
29
28
15
26
1.96
86710228--86710383
82
1.9
81
88
3
233
29
28
15
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86712275--86712313
21
1.9
20
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15
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41
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30
1.83
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2.4
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0
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25
10
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50
2.5
50
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1.97
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240
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22
17
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1.96
86715860--86715913
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2.0
27
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0
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49
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0
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0
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2.2
42
87
2
128
26
12
18
42
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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