Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   

This is table  224  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73378259--73378288
15
2.0
15
100
0
60
6
13
60
20
1.55
73378802--73378833
15
2.0
17
88
11
50
43
31
0
25
1.55
73380199--73380303
53
2.0
53
84
3
140
19
23
19
38
1.93
73387442--73387581
55
2.6
55
81
7
162
20
22
17
39
1.92
73387449--73387639
55
3.6
54
75
9
160
19
24
17
38
1.93
73391182--73391228
20
2.3
20
100
0
94
36
14
0
48
1.44
73392531--73392642
43
2.6
42
81
5
145
30
25
15
29
1.95
73397893--73397945
21
2.5
22
76
11
56
32
18
7
41
1.79
73406572--73406662
22
4.1
22
80
4
94
31
15
24
28
1.95
73406572--73406662
44
2.0
45
81
6
105
31
15
24
28
1.95
73415776--73416043
40
6.7
40
94
0
464
30
20
26
22
1.98
73424358--73424624
40
6.7
40
95
0
455
30
20
26
21
1.98
73424357--73424624
119
2.2
119
94
0
419
30
20
26
21
1.98
73430189--73430218
16
1.9
15
93
6
51
33
23
0
43
1.54
73430430--73430756
50
6.5
50
77
5
196
31
25
16
26
1.96
73430430--73430714
50
5.7
50
79
3
270
29
25
17
27
1.97
73435906--73435992
27
3.2
26
90
6
129
27
19
16
36
1.93
73435918--73436174
27
9.5
27
83
3
266
21
15
21
41
1.90
73442789--73442849
6
10.0
6
73
16
54
77
3
4
14
1.07
73445319--73445743
47
9.1
47
94
1
692
31
9
31
28
1.88
73447750--73447852
43
2.4
43
100
0
206
22
15
35
26
1.94
73447834--73447907
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73448216--73448372
40
3.9
40
78
7
140
26
22
26
24
2.00
73451694--73452118
47
9.1
47
92
2
649
31
8
31
28
1.88
73451694--73452118
187
2.3
187
90
1
665
31
8
31
28
1.88
73451694--73452118
234
1.8
234
89
2
674
31
8
31
28
1.88
73453860--73453905
23
2.0
24
83
12
60
67
0
13
19
1.23
73467217--73467441
40
5.7
40
86
5
296
24
22
28
25
2.00
73467217--73467474
119
2.2
119
81
6
292
25
21
27
25
1.99
73472934--73473211
126
2.2
126
89
3
425
24
26
27
21
2.00
73474607--73474645
6
6.7
6
91
2
62
17
2
0
79
0.84
73474607--73474666
12
5.2
11
76
11
66
16
5
1
76
1.04
73474607--73474669
18
3.6
17
75
10
65
17
4
1
76
1.04
73474607--73474666
24
2.6
23
86
5
84
16
5
1
76
1.04
73479676--73479846
93
1.8
93
92
2
290
21
21
29
28
1.98
73479680--73479851
46
3.7
45
77
14
181
22
20
28
28
1.99
73481413--73481616
104
2.0
104
94
0
354
25
29
24
20
1.99
73482271--73482527
46
5.5
47
77
10
210
20
29
19
30
1.97
73482271--73482530
93
2.8
92
82
8
269
20
29
19
30
1.97
73490434--73490599
49
3.4
49
94
3
300
31
10
28
29
1.90
73490572--73490625
26
2.1
26
100
0
108
27
14
29
27
1.95
73490523--73490674
75
2.0
75
97
0
286
30
11
28
29
1.91
73490598--73490948
49
7.2
49
93
1
584
31
8
30
29
1.87
73490434--73490772
171
2.0
170
97
1
615
30
9
29
29
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73491069--73491147
37
2.1
37
92
0
131
25
18
30
25
1.98
73493883--73494040
86
1.8
86
91
2
264
31
18
16
33
1.93
73506286--73506315
15
2.0
15
93
0
51
50
33
13
3
1.58
73514423--73514475
12
4.4
12
76
9
54
13
24
0
62
1.31
73517948--73518012
17
3.8
16
84
8
67
75
1
7
15
1.10
73517963--73518000
18
2.2
17
95
4
67
81
2
5
10
0.94
73525794--73525820
13
2.1
13
100
0
54
33
7
14
44
1.73
73527891--73527932
21
2.0
21
100
0
84
38
14
19
28
1.90
73527898--73527946
21
2.3
21
86
6
64
44
16
10
28
1.80
73533652--73533834
51
3.6
51
79
2
172
26
21
24
27
1.99
73534144--73534173
16
1.9
15
93
6
51
43
0
23
33
1.54
73538822--73539105
50
5.7
50
76
2
255
29
25
17
27
1.97
73538811--73539100
100
2.9
102
83
1
361
29
25
17
27
1.98
73539894--73539969
38
2.0
38
97
0
143
32
13
22
31
1.92
73541155--73541299
40
3.6
40
84
4
184
25
24
26
24
2.00
73542714--73542760
19
2.3
20
82
10
60
48
14
0
36
1.44
73546382--73546498
42
2.8
42
86
0
153
30
26
15
27
1.96
73551957--73551998
21
2.0
21
90
0
66
73
4
0
21
1.01
73558709--73558751
22
2.0
22
81
9
52
72
0
2
25
0.97
73559820--73560413
23
26.0
23
75
10
421
38
24
6
30
1.81
73559820--73560328
252
2.0
253
93
0
867
37
24
6
31
1.81
73559982--73560413
160
2.7
160
85
4
552
38
23
6
31
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73563889--73563916
8
3.5
8
100
0
56
21
0
0
78
0.75
73563876--73563916
16
2.6
16
88
0
55
24
0
4
70
1.06
73564840--73564906
7
9.4
7
77
3
62
46
29
1
22
1.61
73565852--73565960
37
2.9
37
93
2
175
27
31
18
22
1.97
73566110--73566404
50
5.9
50
92
5
456
30
25
7
36
1.83
73566110--73566404
98
3.0
98
91
4
475
30
25
7
36
1.83
73569855--73570214
40
9.0
40
88
0
540
27
30
21
21
1.98
73569851--73570214
80
4.6
80
96
0
665
27
29
20
21
1.98
73571473--73571581
37
2.9
37
95
0
191
26
31
19
22
1.98
73571731--73572166
50
9.1
48
82
11
520
32
24
6
37
1.80
73571731--73571982
48
5.1
50
89
6
379
32
25
5
36
1.79
73571960--73572016
15
3.7
15
75
9
60
40
15
1
42
1.58
73571957--73572022
32
2.1
32
100
0
132
37
19
3
39
1.67
73571975--73572022
15
2.9
17
72
12
55
37
16
4
41
1.68
73571905--73572066
84
1.9
84
96
0
297
35
21
3
38
1.71
73571807--73572164
184
2.0
181
91
4
576
32
23
5
37
1.79
73574586--73574784
41
4.9
41
81
0
220
21
20
24
34
1.96
73574749--73574821
35
2.1
35
84
5
94
19
17
23
39
1.92
73580681--73580723
21
2.0
21
86
0
59
13
16
11
58
1.64
73582106--73582283
48
3.7
48
89
0
248
19
16
26
37
1.93
73594822--73594939
40
2.9
39
92
2
182
31
29
16
22
1.96
73608982--73609227
51
4.9
51
82
9
292
30
25
17
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73609001--73609231
100
2.3
100
98
0
444
30
25
17
26
1.97
73609880--73609939
30
2.0
30
83
6
77
30
25
8
36
1.85
73611982--73612020
15
2.5
15
91
4
60
56
15
12
15
1.68
73612355--73612456
51
2.0
51
100
0
204
27
27
1
43
1.66
73612363--73612443
24
3.2
24
64
16
65
27
24
2
45
1.66
73613710--73613760
24
2.1
25
96
3
95
43
19
7
29
1.79
73614806--73615056
51
5.0
50
84
3
310
30
26
18
25
1.98
73614817--73615055
100
2.4
100
93
0
397
30
25
18
25
1.98
73616678--73616708
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
73616675--73616714
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
73616900--73617153
55
4.8
54
77
12
226
21
25
16
36
1.94
73618640--73618703
30
2.1
30
94
5
112
37
15
3
43
1.63
73619797--73619842
20
2.3
20
88
0
65
21
6
10
60
1.52
73619805--73619848
20
2.2
20
91
0
70
20
4
9
65
1.38
73623202--73623232
15
2.1
15
93
0
53
19
0
25
54
1.44
73627143--73627242
40
2.5
40
81
9
109
25
26
23
26
2.00
73635353--73635452
40
2.5
40
81
9
109
26
26
23
25
2.00
73653255--73653363
52
2.1
52
94
0
191
32
6
19
42
1.76
73653418--73653635
45
5.0
42
76
7
152
23
16
26
32
1.96
73653421--73653545
45
2.8
45
87
0
169
23
16
25
34
1.95
73655566--73655713
43
3.5
42
72
11
122
28
24
19
27
1.99
73662789--73662936
43
3.5
42
72
11
122
29
24
19
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73680472--73680538
33
2.0
33
97
0
125
22
22
17
37
1.94
73685370--73685470
29
3.5
28
85
5
123
26
14
27
30
1.95
73693385--73693484
28
3.6
27
88
8
137
27
15
28
30
1.96
73697444--73697481
16
2.3
17
86
4
51
42
2
7
47
1.46
73708498--73708632
40
3.3
40
75
12
132
21
14
28
35
1.93
73710682--73710713
15
2.0
17
88
11
50
25
0
31
43
1.55
73713531--73713713
79
2.3
81
83
7
223
24
22
27
24
2.00
73713532--73713715
40
4.6
40
82
9
207
24
22
28
24
2.00
73713584--73713748
79
2.1
79
83
6
201
26
21
27
24
1.99
73730100--73730141
20
2.1
20
82
8
50
11
7
11
69
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349