Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115637255

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  273  of  349  ( 41854 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91014662--91014764
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37
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6.6
40
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26
28
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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188
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1.98
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1.98
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1.99
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1.98
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30
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1.98
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20
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0
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25
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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(0-2)
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1.99
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19
34
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91327115--91327233
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29
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21
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1.99
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0
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19
34
1.89
91335168--91335287
24
5.0
24
82
11
140
30
23
20
25
1.99
91335170--91335288
47
2.5
47
85
9
152
30
22
21
26
1.99
91335480--91335543
31
2.1
31
90
0
101
35
15
23
25
1.94
91342445--91342504
23
2.6
23
97
0
111
16
30
30
23
1.96
91343087--91343179
47
2.0
47
89
0
141
24
24
30
20
1.99
91347873--91347915
21
2.0
22
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13
54
2
16
20
60
1.46
91349082--91349147
9
6.8
10
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13
59
37
7
19
34
1.80
91349082--91349146
29
2.2
29
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7
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1.80
91349079--91349152
5
15.4
5
75
18
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37
6
20
35
1.79
91349120--91349164
20
2.2
20
96
0
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37
8
20
33
1.83
91349111--91349152
9
4.4
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11
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4
21
38
1.75
91349214--91349388
26
6.8
26
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257
26
23
22
26
2.00
91349214--91349401
52
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52
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28
22
22
26
1.99
91357446--91357502
9
5.8
10
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15
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38
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1.82
91357445--91357519
20
3.8
20
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1.83
91357464--91357519
11
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11
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16
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37
10
19
32
1.86
91357569--91357647
26
3.2
26
87
7
112
30
18
22
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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40
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1.72
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47
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28
25
1.90
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22
5.3
22
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24
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1.94
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2.0
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0
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1.87
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1.99
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24
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1.99
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36
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1.83
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55
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1.96
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47
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1024
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29
29
1.87
91393115--91393732
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3.3
190
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29
1.87
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4.6
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1.97
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160
29
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29
22
1.98
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28
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22
1.97
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1.9
140
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304
28
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1.97
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2
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32
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51
20
0
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2.1
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0
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1.44
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2.4
56
93
0
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26
16
22
34
1.95
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24
1.9
23
86
4
63
42
0
15
42
1.47
91422369--91422408
20
2.1
19
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0
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1.42
91425877--91426023
73
2.0
73
100
0
294
32
10
14
41
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91429168--91429199
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2.0
16
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0
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25
15
15
43
1.86
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3.7
47
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219
27
19
28
24
1.99
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49
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48
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189
27
18
28
24
1.98
91431045--91431264
98
2.3
95
84
7
266
27
20
27
24
1.99
91430955--91431267
48
6.5
47
75
10
190
27
18
28
24
1.98
91441327--91441497
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3.8
45
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14
206
21
21
28
29
1.98
91441324--91441492
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1.8
92
93
2
295
21
21
28
28
1.98
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1
207
20
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27
30
1.98
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2.0
20
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15
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36
0
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3.6
45
87
6
210
30
16
28
24
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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