Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  10  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
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3.4
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22
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55
5
1
38
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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1
182
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25
13
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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1.93
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2.3
97
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13
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1.93
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0
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20
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49
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3611782--3611848
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2.5
31
86
2
118
42
1
7
48
1.40
3650338--3650419
41
2.0
42
80
7
96
45
7
13
34
1.71
3664251--3664310
31
2.0
30
86
3
84
40
6
3
50
1.45
3664456--3664832
188
2.0
188
98
0
736
37
18
22
21
1.94
3674076--3674122
15
3.1
15
78
6
58
61
10
8
19
1.53
3688173--3688286
9
12.9
9
67
18
53
39
0
2
57
1.12
3688223--3688271
19
2.6
19
76
0
62
40
0
0
59
0.98
3688261--3688299
15
2.5
16
80
20
55
23
0
5
71
1.05
3688415--3688465
23
2.2
23
82
6
59
33
9
13
43
1.77
3689921--3689969
25
2.0
25
88
8
73
36
16
10
36
1.82
3696051--3696146
47
2.0
47
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7
124
44
0
10
44
1.38
3705292--3705333
18
2.4
19
80
15
54
76
14
2
7
1.10
3721640--3721680
20
2.1
20
95
4
75
43
0
26
29
1.55
3731284--3731383
51
2.0
51
88
4
148
31
27
18
24
1.97
3746330--3746420
44
2.0
45
89
2
139
43
15
8
31
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3749797--3749824
2
14.0
2
100
0
56
50
50
0
0
1.00
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22
2.0
21
90
4
66
28
4
4
61
1.36
3754069--3754094
13
2.0
13
100
0
52
53
0
7
38
1.30
3754158--3754203
22
2.1
22
84
8
58
8
23
0
67
1.18
3755032--3755070
15
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14
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0
0
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0.92
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14
2.5
13
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13
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34
0
0
65
0.93
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16
2.4
17
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4
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48
0
2
48
1.15
3760161--3760210
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2.1
24
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1.68
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18
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33
38
1
26
1.66
3760186--3760246
32
1.9
32
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0
104
31
36
1
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1.68
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3
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100
0
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0
32
0
67
0.91
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2.3
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7
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7
5
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1.56
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15
2.5
15
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4
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75
0
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13
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110
2.1
109
82
7
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30
16
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31
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0
100
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2.4
91
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3
309
58
12
5
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1.54
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21
2.4
21
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0
0
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24
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0
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12
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16
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0
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38
0
0
61
0.96
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16
2.2
16
100
0
70
31
34
5
28
1.81
3812839--3812877
11
3.5
11
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6
51
20
5
0
74
1.01
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23
2.0
23
90
0
72
33
0
8
57
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3821026--3821056
14
2.2
14
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0
53
25
0
6
67
1.14
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31
1.9
31
93
3
102
42
5
1
50
1.34
3835167--3835212
23
1.9
25
86
8
69
69
4
2
23
1.17
3835521--3835624
41
2.6
41
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14
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60
2
1
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4
100
0
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0
0
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0.76
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2.0
39
100
0
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27
2.0
27
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0
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1
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24
1.58
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26
2.3
25
81
13
68
58
8
1
31
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356