Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  318  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102919940--102919971
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Indices
Period
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Indels
Score
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1.9
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2.7
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0
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31
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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24
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1.94
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2.6
139
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430
29
14
24
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1.94
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4.0
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27
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2.9
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2.3
175
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481
27
16
20
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
103048757--103049152
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19
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1.30
103051945--103051983
18
2.2
18
85
0
51
25
5
2
66
1.25
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20
2.7
20
81
6
61
62
5
0
31
1.19
103056745--103056790
19
2.4
19
88
3
65
58
6
0
34
1.24
103056746--103056798
19
2.8
19
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58
3
0
37
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21
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103058329--103058428
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3
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0
0
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24
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3
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3
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0
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3
49
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103093145--103093213
29
2.4
28
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13
77
39
5
4
50
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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19
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3.8
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57
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28
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2
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2.1
22
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0
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2.4
45
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6
175
39
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15
27
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103159608--103159652
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0
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23
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17
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0
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84
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407
33
21
23
20
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356