Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          353   354   355   356   

This is table  250  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.00
Indices
Period
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Score
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Period
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Copy
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Score
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26
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26
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69
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7
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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1.92
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50
85
2
8
2
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82187360--82187406
20
2.3
20
81
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34
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23
1.92
82188949--82188981
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10
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4
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6
9
0
0.76
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20
2.3
20
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82193373--82193420
21
2.3
21
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0
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83
4
10
2
0.87
82196210--82196256
20
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20
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1.92
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20
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23
1.92
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47
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1
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1.89
82215439--82215676
93
2.5
94
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352
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28
1.89
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27
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1.94
82219816--82219876
20
3.0
20
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26
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1.93
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0
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24
20
28
27
1.99
82232403--82232634
40
5.8
40
93
1
315
24
20
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.0
20
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1.96
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2.0
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1.79
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21
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1.84
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2.0
30
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3
80
11
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0
35
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1.06
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4.1
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64
1
2
31
1.15
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2.0
140
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399
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7
9
30
1.61
82283423--82283779
140
2.5
137
81
5
358
52
9
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28
1.64
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0
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58
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11
2.3
11
100
0
50
16
8
24
52
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82289775--82289839
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2.3
28
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0
103
29
23
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36
1.88
82289775--82289856
28
2.9
28
85
0
101
29
24
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1.91
82296561--82296731
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1.8
93
94
0
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1.99
82296565--82296736
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3.7
46
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199
22
22
27
27
1.99
82315730--82315807
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2.4
32
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0
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25
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1.98
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40
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25
2.00
82333612--82333786
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20
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26
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82338210--82338281
28
2.6
28
88
0
99
29
27
12
30
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356