Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  48  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
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1.18
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19
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143
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29
20
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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22
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50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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0
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15821209--15821392
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207
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22
27
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15821261--15821425
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2
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23
88
7
71
66
12
6
14
1.42
15857398--15858257
132
6.5
132
92
2
1293
29
25
16
28
1.97
15857411--15858282
220
4.0
221
78
7
681
30
25
16
27
1.97
15878086--15878152
1
67.0
1
100
0
134
0
0
0
100
0.00
15886761--15886848
43
2.0
43
100
0
176
36
15
9
38
1.80
15891158--15891196
16
2.4
16
100
0
78
35
7
28
28
1.85
15891182--15891269
44
2.0
44
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8
115
32
6
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37
1.81
15903641--15903676
3
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3
100
0
72
33
0
33
33
1.58
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17
2.0
18
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25
5
22
45
1.74
15912007--15912050
22
2.0
22
100
0
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36
22
4
36
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32
2.1
32
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0
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10
19
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1.86
15917770--15917812
22
2.0
22
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0
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32
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27
2.0
27
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0
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14
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13
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7
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1
1
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2.1
71
91
0
248
27
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16
2.7
18
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36
0
0
63
0.94
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28
2.1
28
100
0
120
46
6
3
43
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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0
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32
0
24
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15
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15
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10
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8
28
1.57
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34
2.0
33
85
8
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32
15
16
35
1.91
15955592--15955860
9
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9
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21
101
33
1
4
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1.24
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0
0
70
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0
3
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0
0
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1
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2.4
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29
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13
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1.93
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0
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0
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0
0
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0
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0
0
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1.24
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2.0
21
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11
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0
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0
0
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4.0
12
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0
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1
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10
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2.0
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2
1
42
1.20
16017083--16017135
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23
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13
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7
13
13
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1.45
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2.0
37
100
0
150
38
21
16
24
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16040212--16040255
18
2.4
18
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0
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1.51
16050573--16050700
34
3.7
34
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118
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9
9
18
1.52
16052694--16052803
58
1.9
58
88
0
166
31
25
17
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4
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0
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0
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0
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0.80
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1
1
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1.16
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23
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2.0
23
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5
0
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21
2.9
21
75
2
59
8
6
10
75
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356