Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  46  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15016485--15016528
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0
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1
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15018687--15018748
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4.3
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9
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2.3
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15035170--15035238
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1
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36
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0
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28
1.93
15047169--15047489
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3.3
97
84
10
436
34
14
22
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15047453--15047561
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37
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2
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22
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15054209--15054425
55
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17
147
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5
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1.79
15056052--15056124
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2.5
29
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0
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1.20
15056115--15056155
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0
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0
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0
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0
0
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0
0
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2.7
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0
0
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2
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3.1
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2
42
1.41
15060802--15061099
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2.5
120
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492
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0
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3
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7.2
28
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14
22
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3.2
56
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14
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1.63
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1.8
112
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7
14
23
1.64
15065391--15065581
84
2.3
84
79
7
210
55
7
13
23
1.64
15075354--15075451
27
3.6
27
88
0
133
35
16
21
26
1.94
15075352--15075469
27
4.4
27
85
1
121
36
15
19
28
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15075609--15075672
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21
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2.0
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23
24
26
2.00
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2.1
23
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17
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63
1.48
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12
2.1
12
100
0
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16
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0
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20
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1
1
50
1.16
15091501--15091589
7
13.3
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74
17
64
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1
1
49
1.16
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3.0
22
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93
16
22
19
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0
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1.93
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18
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1.92
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1.8
138
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17
18
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1.95
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15
18
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1.93
15099399--15099569
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184
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1.20
15119030--15119099
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56
42
4
0
52
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15119187--15119227
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0
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100
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50
54
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3
36
1.41
15125994--15126024
12
2.6
12
94
0
53
54
6
0
38
1.26
15125936--15126137
110
1.8
109
91
3
334
59
4
3
31
1.35
15126188--15126237
22
2.3
22
80
16
59
70
4
2
24
1.15
15126293--15126322
3
9.7
3
92
7
51
63
0
0
36
0.95
15126405--15126464
31
1.9
31
83
12
79
60
8
0
31
1.27
15125998--15126485
153
3.3
148
86
8
680
59
5
4
31
1.38
15127063--15127092
10
3.0
10
95
0
51
16
0
3
80
0.85
15127136--15127178
22
1.9
23
95
4
79
74
0
9
16
1.06
15127727--15127912
16
12.1
15
75
10
117
24
10
30
34
1.89
15127762--15127823
30
2.1
30
85
8
83
22
9
33
33
1.87
15127748--15127857
45
2.4
45
87
0
166
21
10
31
36
1.87
15129485--15129612
38
3.4
38
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186
36
10
14
38
1.80
15131005--15131099
28
3.4
27
78
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64
1
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29
1.22
15131050--15131099
18
2.8
18
71
17
50
64
0
2
34
1.05
15131060--15131102
18
2.3
18
88
4
59
62
0
2
34
1.08
15131077--15131264
9
20.2
9
68
16
73
60
3
1
35
1.23
15131087--15131160
29
2.6
29
77
12
80
63
6
0
29
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15131113--15131164
19
2.9
18
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13
63
65
3
0
30
1.10
15131113--15131177
8
7.5
8
73
20
51
64
4
0
30
1.14
15131142--15131179
15
2.4
17
82
13
53
65
2
0
31
1.06
15131679--15131741
30
2.1
30
93
0
108
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12
3
28
1.52
15131718--15131750
17
1.9
17
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3
0
27
1.03
15132234--15132272
9
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9
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51
28
0
2
69
1.02
15132295--15132352
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10
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39
5
0
55
1.22
15132292--15132402
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2
53
1.38
15132345--15132428
18
4.5
18
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12
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4
55
1.42
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27
2.7
26
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18
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64
2
2
29
1.22
15132965--15133130
19
8.8
19
70
24
81
65
2
1
30
1.16
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21
2.3
22
85
7
64
62
2
0
35
1.07
15133043--15133130
31
2.9
31
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15
78
64
2
1
31
1.13
15133462--15133533
9
8.1
9
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16
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37
2
1
58
1.21
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28
2.8
27
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16
77
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2
1
61
1.18
15133418--15133577
10
17.2
9
70
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36
3
1
58
1.27
15133665--15133702
18
2.2
18
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4
51
39
5
21
34
1.76
15135942--15135979
17
2.2
18
85
4
51
42
2
2
52
1.29
15135961--15136016
29
1.9
29
92
0
94
28
3
12
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1.54
15136022--15136048
13
2.1
13
100
0
54
29
7
14
48
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15136731--15136824
9
10.3
9
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19
52
23
4
2
70
1.16
15143025--15143088
32
2.1
30
85
5
83
59
12
1
26
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15143176--15143200
13
1.9
13
100
0
50
72
16
0
12
1.13
15143800--15143869
32
2.2
32
100
0
140
20
24
0
55
1.43
15145768--15145916
41
3.6
41
87
0
199
17
16
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40
1.90
15145762--15145916
82
1.9
82
86
0
220
17
16
25
40
1.90
15148108--15148148
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2.0
21
85
9
57
17
0
24
58
1.38
15149770--15149811
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1.9
22
95
0
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59
2
11
26
1.45
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1.9
37
94
0
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35
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1.96
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2.0
29
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41
1
5
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1.34
15161616--15161909
150
2.0
149
91
3
486
40
7
7
44
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356