Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  238  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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2.3
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0
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0.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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403
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26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78475053--78475344
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27
31
15
26
1.96
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100
0
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31
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16
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2
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30
29
20
20
1.97
78487073--78487248
46
3.8
45
76
12
160
31
28
19
19
1.97
78487126--78487267
46
3.1
46
73
18
132
30
29
19
20
1.97
78488981--78489014
17
1.9
18
88
5
52
11
35
32
20
1.89
78496319--78496353
16
2.1
16
89
5
52
25
2
11
60
1.45
78496412--78496442
15
2.1
15
93
0
53
32
25
3
38
1.72
78504636--78504672
17
2.2
17
90
0
56
37
10
18
32
1.86
78509620--78509644
8
3.1
8
100
0
50
52
0
0
48
1.00
78509851--78509894
17
2.5
17
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3
61
31
0
0
68
0.90
78509858--78509896
16
2.4
17
83
12
55
35
0
0
64
0.94
78513598--78513691
31
3.0
31
84
1
116
26
1
17
55
1.49
78513649--78513707
22
2.7
22
84
5
75
27
0
22
50
1.49
78523770--78524077
40
7.7
40
94
0
526
22
26
20
31
1.98
78538232--78538269
19
2.0
19
94
0
67
44
5
0
50
1.24
78542850--78542900
25
2.0
26
88
3
77
47
0
1
50
1.12
78543042--78543216
85
2.1
85
98
0
341
37
15
12
34
1.85
78543937--78543971
12
2.9
12
91
0
52
28
0
0
71
0.86
78548451--78548495
5
8.6
5
82
7
54
73
2
20
4
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78549208--78549271
5
12.6
5
87
9
94
40
0
0
59
0.97
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13
4.2
13
81
11
60
74
3
0
21
0.97
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13
3.3
13
76
20
50
72
5
0
22
1.04
78567922--78568119
106
1.9
105
82
5
247
15
26
25
32
1.95
78569237--78570885
549
3.0
546
92
1
2702
24
20
17
36
1.95
78583277--78583322
6
7.3
6
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9
65
78
4
0
17
0.91
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2.0
20
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0
53
77
5
0
17
0.94
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9
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75
11
50
27
8
22
42
1.82
78583351--78583401
18
2.8
18
75
0
57
27
7
21
43
1.80
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24
1.9
24
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8
67
41
6
6
45
1.56
78598922--78599332
131
3.2
131
81
4
465
30
15
13
39
1.87
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64
3.0
64
65
15
151
31
15
13
39
1.86
78610216--78610457
115
2.1
115
99
0
475
40
7
10
41
1.67
78611603--78611677
21
3.0
26
80
14
72
49
0
5
45
1.25
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21
2.0
19
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14
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53
0
0
46
1.00
78616386--78616462
38
2.0
38
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136
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22
2.0
24
84
8
62
34
2
10
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1.48
78629916--78629968
27
2.0
27
82
7
65
45
9
5
39
1.60
78642328--78642507
89
2.0
89
98
0
351
48
6
6
38
1.54
78646384--78646550
43
3.9
43
76
8
162
28
13
25
32
1.94
78652808--78652955
74
2.0
74
95
0
269
22
9
30
37
1.86
78658979--78659057
40
2.0
40
92
0
131
35
13
10
40
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78659782--78659826
20
2.2
20
88
0
63
48
2
13
35
1.54
78670253--78670632
47
8.1
47
94
0
607
28
30
9
32
1.88
78676717--78677256
137
3.9
137
90
1
789
29
22
17
30
1.96
78676777--78677255
45
10.5
45
67
19
190
28
24
17
29
1.97
78676673--78677236
274
2.0
275
89
1
869
29
23
16
31
1.96
78677213--78677479
133
2.0
133
85
0
363
29
25
17
27
1.98
78682533--78682710
27
6.6
27
81
3
187
26
14
28
30
1.95
78682530--78682710
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2.2
81
81
2
211
26
14
28
30
1.95
78695672--78695709
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
78708291--78708316
13
2.0
13
100
0
52
23
23
23
30
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          353   354   355   356