Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  83  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26139669--26139727
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1.9
31
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3
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65
3
1
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1.20
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22
2.6
23
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1
1
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81
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100
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2
2
58
1.24
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31
1.9
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13
86
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5
0
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1.18
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0
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0
50
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1.9
18
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1.07
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0
0
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50
36
0
0
63
0.95
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2.9
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2.3
18
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2
7
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4.9
45
94
0
375
38
15
20
25
1.92
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45
5.9
45
93
2
420
39
15
20
25
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50
2.0
50
87
0
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28
22
26
23
1.99
26201353--26201450
25
4.0
24
78
5
97
28
22
25
23
1.99
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6.0
47
87
2
344
22
23
15
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26208675--26208726
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4.7
11
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9
52
63
3
0
32
1.12
26211936--26211979
12
3.4
12
77
17
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59
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2
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1.48
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27
2.0
27
100
0
106
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22
1.56
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12
3.0
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20
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54
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2
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26211981--26212016
15
2.4
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100
0
72
36
36
0
27
1.57
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23
1.9
23
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9
63
36
13
9
40
1.76
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40
3.4
40
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7
157
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18
24
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1.9
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1.58
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15
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16
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53
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3
40
1.34
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20
2.0
20
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39
2
13
44
1.57
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17
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17
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52
55
0
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2.0
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3
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12
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33
2.3
33
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73
2
12
10
1.19
26238766--26238821
22
2.5
22
82
0
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30
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1.97
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17
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51
2
4
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1.35
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24
2.2
24
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0
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32
1.51
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2.0
20
100
0
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20
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35
0
0
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31
0
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34
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2.6
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78
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116
35
4
28
31
1.77
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2.0
17
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54
0
0
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2.0
157
97
0
598
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3
5
47
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26262428--26262462
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2.0
17
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5
52
54
0
0
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2.0
21
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0
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13
25
18
41
1.88
26268070--26268114
21
2.1
21
91
0
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22
2
20
55
1.54
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16
2.0
16
100
0
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31
6
18
43
1.75
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1.9
13
100
0
50
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4
8
1.47
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3.0
43
81
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32
28
16
23
1.96
26283845--26283974
43
3.0
44
82
6
149
32
28
16
23
1.96
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3.3
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60
0
4
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1.17
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0
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9
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27
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0
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22
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1.30
26293906--26294000
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18
1.24
26293956--26294016
22
2.8
21
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11
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1.91
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12
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1.44
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25
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65
58
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29
1.48
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0
0
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19
2.2
18
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13
55
37
0
0
62
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26335044--26335092
23
2.1
23
85
7
64
48
0
0
51
1.00
26335061--26335099
20
1.9
21
84
5
53
56
0
0
43
0.99
26336788--26336840
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0
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0
0
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21
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23
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27
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2.00
26342150--26342320
78
2.2
78
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6
238
25
22
28
24
2.00
26342150--26342353
79
2.6
79
83
5
218
26
21
27
24
1.99
26352695--26352735
21
2.0
21
95
0
73
19
17
31
31
1.95
26363625--26363686
10
6.1
10
84
1
61
67
0
9
22
1.19
26363627--26363686
20
3.0
20
82
0
84
68
0
10
21
1.19
26363627--26363684
30
1.9
30
86
6
82
68
0
10
20
1.18
26367993--26368078
34
2.5
34
96
0
154
55
6
11
25
1.60
26368849--26368896
10
4.8
10
80
16
55
64
2
10
22
1.35
26372232--26372269
18
2.1
18
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0
67
50
10
0
39
1.37
26374740--26374859
59
2.0
59
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0
204
20
31
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1.91
26378077--26378111
12
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12
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4
52
68
0
0
31
0.90
26378521--26378573
18
2.9
19
75
8
56
66
0
1
32
1.03
26379599--26379687
29
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28
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28
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38
12
0
49
1.41
26379610--26379697
19
5.1
18
70
24
73
38
14
0
46
1.45
26379596--26379693
49
2.0
49
100
0
196
36
14
0
48
1.44
26379656--26379708
19
2.8
20
77
11
58
39
11
0
49
1.39
26387632--26387663
15
2.2
15
94
5
57
65
0
3
31
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26388959--26388991
17
1.9
17
93
0
57
30
6
12
51
1.63
26392316--26392396
21
3.8
21
76
3
63
38
24
20
16
1.92
26392312--26392386
21
3.4
23
76
14
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40
25
20
14
1.90
26392770--26392827
15
3.8
15
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2
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12
0
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1.39
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5
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0
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0
0
40
0.97
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0
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0
0
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0.96
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2.3
22
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6
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34
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12
1.92
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4.0
23
77
10
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37
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21
16
1.93
26399177--26399234
15
3.8
15
88
2
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51
12
0
36
1.39
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5
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50
58
0
0
41
0.98
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100
0
58
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0
0
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2.0
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0
39
1.17
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2.2
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10
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0
0
46
1.00
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134
2.7
133
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5
352
30
17
18
33
1.94
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15.9
44
88
0
966
28
14
29
27
1.96
26423936--26423965
14
2.1
14
100
0
60
40
16
0
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1.48
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12
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4
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13
5
0
81
0.86
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6
10.7
6
81
12
64
16
4
0
78
0.90
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41
2.2
41
80
7
105
32
34
13
19
1.90
26431242--26431275
18
1.9
18
88
5
52
52
2
23
20
1.60
26432497--26432536
13
3.1
13
79
13
55
30
0
2
67
1.04
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19
2.0
19
89
0
58
52
0
5
42
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26441183--26441247
20
3.1
22
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20
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38
1
1
58
1.17
26445573--26445683
17
6.5
17
72
20
72
42
3
1
52
1.29
26445589--26445723
68
2.0
69
86
1
191
40
4
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51
1.40
26446520--26446583
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2.1
31
100
0
128
29
35
12
21
1.91
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45
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13
215
24
31
17
26
1.97
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96
1.9
96
85
5
249
24
31
18
24
1.97
26473950--26474254
46
6.4
48
73
15
203
24
31
17
26
1.97
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27
6.6
27
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5
173
26
15
29
29
1.96
26477443--26477620
54
3.3
55
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5
200
26
15
28
29
1.96
26477444--26477599
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356