Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  41  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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Copy
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Score
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
60
73
0
8
17
1.07
13636954--13637000
17
2.8
17
80
9
60
74
0
8
17
1.05
13636992--13637033
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15
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52
78
2
14
4
1.01
13636992--13637033
5
8.4
5
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10
50
78
2
14
4
1.01
13646673--13646703
16
1.9
16
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0
53
32
0
3
64
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13647809--13647866
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18
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29
10
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43
1.82
13647858--13647924
31
2.2
31
100
0
134
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37
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13647858--13647933
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13649985--13650009
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12
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0
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24
1.94
13657504--13657569
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33
100
0
132
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1.30
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10
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17
1.62
13682362--13682404
23
1.9
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4
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27
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16
1.64
13683087--13683180
42
2.2
42
84
5
118
29
20
20
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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43
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27
1.98
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28
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28
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0
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1.97
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16
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1
1
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18
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0
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18
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2
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1.45
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2.1
27
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24
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0
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0
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32
1.84
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1.9
19
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56
38
0
27
33
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13739713--13739785
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0
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19
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51
0
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22
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24
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2.0
58
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0
207
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23
23
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356