Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  64  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20309426--20309491
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1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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22
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22
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132
29
25
13
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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23
18
28
1.98
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193
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50
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20473092--20473129
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11
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20499288--20499577
71
4.2
70
77
9
265
28
14
12
44
1.81
20499389--20499622
119
2.0
120
81
7
280
27
12
13
46
1.80
20499518--20499562
17
2.6
17
82
0
54
26
15
15
42
1.87
20499590--20499681
18
5.2
17
73
21
75
34
13
10
41
1.79
20499607--20499649
20
2.1
21
91
4
70
41
13
9
34
1.77
20499582--20499664
37
2.2
37
82
4
96
37
10
9
42
1.73
20501214--20501272
30
1.9
31
89
3
93
27
23
1
47
1.61
20501995--20502044
25
2.0
25
100
0
100
40
4
12
44
1.60
20501998--20502055
25
2.4
25
88
2
82
50
3
8
37
1.50
20502380--20502423
6
7.2
6
81
2
52
0
56
0
43
0.99
20502380--20502423
18
2.4
18
92
3
70
0
56
0
43
0.99
20502483--20502532
25
2.0
25
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0
73
4
30
4
62
1.32
20506119--20506157
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2.0
20
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0
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0
2
48
1.15
20506257--20506295
20
2.0
20
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0
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46
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12
28
1.79
20506244--20506309
34
1.9
35
90
3
107
43
13
10
31
1.78
20506279--20506318
14
2.9
14
84
0
53
42
17
7
32
1.77
20508176--20508229
23
2.5
22
87
6
74
59
7
1
31
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20508179--20508247
3
22.3
3
76
5
66
62
5
1
30
1.27
20508710--20508747
11
3.2
12
88
11
60
47
0
52
0
1.00
20509108--20509224
54
2.2
54
98
0
225
39
33
3
23
1.72
20514559--20514592
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
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17
2.0
17
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0
59
44
50
0
5
1.26
20519292--20519331
21
2.0
19
85
9
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10
10
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75
1.19
20524267--20524337
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2.0
35
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0
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8
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1.83
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36
100
0
150
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2
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1.39
20537172--20537218
21
2.2
22
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21
19
38
21
1.94
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53
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4
27
1.59
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25
2.1
26
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10
74
22
13
9
54
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34
1.9
35
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3
89
21
18
18
42
1.89
20571282--20571327
16
2.9
16
83
0
56
45
4
26
23
1.71
20571281--20571336
16
3.5
16
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16
53
42
7
26
23
1.79
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2.0
18
100
0
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0
0
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18
2.0
18
100
0
72
61
0
0
38
0.96
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13
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12
55
58
0
0
41
0.98
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120
3.3
120
97
0
729
52
4
0
42
1.28
20571899--20571956
26
2.4
23
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11
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55
1
0
43
1.10
20571826--20572007
101
1.8
100
93
1
319
50
5
1
42
1.35
20572077--20572145
19
3.8
19
73
19
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44
7
2
44
1.46
20572182--20572208
12
2.2
12
100
0
54
37
22
7
33
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20572405--20572431
12
2.2
12
100
0
54
33
22
25
18
1.97
20578029--20578057
8
3.6
8
100
0
58
79
0
20
0
0.74
20579412--20580665
132
9.5
132
84
7
1472
28
19
24
28
1.98
20582405--20582528
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2.0
62
100
0
248
38
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6
43
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21
2.0
21
90
0
64
19
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21
29
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20593266--20593315
21
2.3
22
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40
2
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20593315--20593347
17
2.0
17
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9
0
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11
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1.77
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14
3.3
13
84
9
56
0
17
0
82
0.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356