Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  316  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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20
2.6
20
79
11
70
63
0
0
36
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2.0
63
93
1
214
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1
3
41
1.27
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17
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17
78
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70
50
1
1
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1.18
102615812--102615836
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2.1
12
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0
50
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16
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18
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0
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0
31
31
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102630695--102630754
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2.0
30
93
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26
13
8
51
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18
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0
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100
0
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20
0
0
79
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0
0
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2.6
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0
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57
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102638244--102638303
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7.9
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55
0
1
43
1.10
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21
2.6
20
88
11
74
59
0
0
40
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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0
0
38
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5
14
1.05
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2.7
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1.04
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27
2.6
25
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2
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0
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1
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0
0
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0
0
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1.00
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0
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1.00
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0
0
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1.11
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2
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1.9
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35
0
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1.09
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2.1
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0
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0
0
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2.5
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0
1
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1.04
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0
0
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5.3
7
90
6
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66
0
0
33
0.92
102651041--102651092
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63
0
0
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0.95
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1.9
62
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197
54
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1.27
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4.0
17
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1
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51
1
1
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1.18
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2.1
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194
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4
5
40
1.45
102666481--102666799
46
6.9
46
90
1
451
41
14
22
21
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102670751--102670818
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4.9
13
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22
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51
1
0
47
1.09
102670751--102670883
14
9.2
14
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18
51
51
3
1
43
1.26
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1.8
90
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248
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5
3
39
1.42
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2.0
20
85
10
53
51
2
0
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0
0
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0.95
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0
1
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1.02
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0
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3
14
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2.3
16
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58
59
0
0
40
0.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356