Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  11  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3861825--3861895
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2.2
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2
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82
0.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
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0
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116
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0
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57
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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12
70
15
50
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3
2
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0
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18
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0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3965227--3965271
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18
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0
0
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1.00
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2.5
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16
57
40
0
4
55
1.19
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50
2.0
50
96
0
182
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15
17
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1.87
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10
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6
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38
0
5
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1.23
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27
2.0
27
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3
70
36
0
5
57
1.23
3993308--3993350
22
2.0
23
86
9
63
41
16
11
30
1.83
4002378--4002433
22
2.5
23
77
16
64
57
5
1
35
1.32
4006797--4006872
29
2.5
30
78
4
82
30
7
6
55
1.54
4011978--4012033
23
2.4
23
100
0
112
25
32
28
14
1.94
4012522--4012626
50
2.1
50
96
1
194
39
22
7
30
1.82
4014415--4014451
20
1.9
18
89
10
56
35
21
0
43
1.53
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27
2.0
27
100
0
108
48
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7
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1.59
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57
11
9
21
1.62
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100
0
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1.38
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2.7
12
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0
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18
1.62
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2.0
13
100
0
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31
2.7
31
79
7
89
36
13
14
35
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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2
0
26
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10
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1
0
32
1.00
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2.0
22
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13
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0
0
38
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17
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1
0
32
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2.0
21
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30
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1.66
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2.0
21
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117
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2.7
27
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13
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13
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10
14
0
74
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4091609--4091652
22
2.0
22
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8
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0
2
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1.13
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2.0
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1.9
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0
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0
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23
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0
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0.92

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          353   354   355   356