Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  9  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.2
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28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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T
Entropy
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46
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5.2
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303
34
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22
28
1.93
3204275--3204543
98
2.8
98
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1
452
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2.2
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19
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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21
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23
82
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2
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23
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1.9
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89
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24
3
41
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3308775--3308846
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1.12
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24
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1
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15
52
38
0
2
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14
75
42
1
2
54
1.21
3313670--3313766
20
4.8
20
70
13
74
42
2
2
53
1.24
3314432--3314502
37
1.9
36
86
8
99
52
4
1
42
1.29
3314523--3314582
23
2.7
23
82
10
63
56
1
0
41
1.09
3314599--3314672
36
2.0
37
85
12
100
68
4
5
21
1.26
3314594--3314645
18
2.9
18
77
5
52
67
1
3
26
1.18
3314688--3314729
9
4.7
9
93
0
75
78
0
9
11
0.96
3316611--3316637
10
2.7
10
100
0
54
29
11
11
48
1.73
3316743--3317269
173
3.0
173
99
0
1045
32
11
14
41
1.82
3320010--3320050
19
2.1
19
86
4
55
29
0
2
68
1.03
3329977--3330016
20
2.0
20
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0
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32
10
12
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1.75
3329962--3330026
34
1.9
33
87
9
96
35
9
13
41
1.77
3330117--3330155
20
2.0
20
94
0
69
48
2
0
48
1.15
3332710--3332766
2
28.5
2
96
0
105
49
49
0
1
1.11
3332982--3333067
40
2.2
40
100
0
172
25
30
23
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3336811--3336894
17
5.1
17
72
5
82
34
35
8
21
1.84
3336810--3336894
33
2.6
33
78
0
107
34
36
8
21
1.83
3337676--3337725
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
3342316--3342365
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
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16
5.9
16
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4
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22
8
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34
1.84
3345502--3345590
33
2.7
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23
7
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34
1.84
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20
2.0
20
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0
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0
2
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0
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1.65
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28
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10
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3
0
46
1.17
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16
2.3
17
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18
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22
2
5
69
1.22
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3.2
12
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25
2
0
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2.0
15
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0
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30
0
3
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1.07
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31
93
0
102
31
3
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1.50
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31
1.9
31
89
0
93
40
6
15
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0
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3
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3
100
0
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0
31
0
0.90
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2.0
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0
0
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20
2.4
20
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22
55
40
0
0
59
0.97
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30
2.9
30
74
10
86
29
9
25
36
1.87
3397102--3397131
15
2.1
15
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6
53
80
0
0
20
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16
3.1
16
78
16
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56
0
0
44
0.99
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21
2.5
23
80
8
62
10
7
1
80
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3405089--3405160
8
8.4
8
72
14
54
11
5
5
77
1.10
3405176--3405237
29
2.2
29
97
2
117
38
0
4
56
1.21
3406096--3406160
18
3.6
17
82
13
78
80
4
4
10
1.01
3406171--3406261
17
5.5
17
75
7
80
76
3
10
8
1.11
3406180--3406261
33
2.5
33
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4
112
76
2
12
8
1.10
3406484--3406543
29
2.1
29
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40
0
11
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1.40
3411132--3411176
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2.0
23
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2.0
23
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0
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2.0
20
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14
55
58
5
0
35
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356