Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  42  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
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20
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
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28
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10
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27
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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28
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27
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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33
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49
3.4
48
80
11
187
24
29
20
26
1.99
13981409--13982574
582
2.0
582
98
0
2251
28
26
16
27
1.97
13984423--13984736
46
6.8
46
93
1
479
21
24
14
39
1.91
13986815--13986876
31
2.0
31
87
0
88
58
3
0
38
1.15
13997930--13998102
46
3.6
48
86
7
221
20
23
15
41
1.90
14011418--14011442
13
1.9
13
100
0
50
16
40
32
12
1.84
14020784--14020812
13
2.2
13
100
0
58
31
0
13
55
1.39
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6
4.2
6
100
0
50
16
0
0
84
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20
2.0
20
85
9
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57
20
22
0
1.41
14029148--14029176
13
2.2
13
100
0
58
31
0
13
55
1.39
14036373--14036424
23
2.3
23
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15
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21
7
3
67
1.32
14041361--14041389
14
2.0
15
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6
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51
20
0
27
1.47
14045528--14045704
50
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50
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0
291
35
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25
1.94
14045680--14045766
31
2.8
31
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0
129
27
18
27
26
1.98
14045788--14045911
49
2.6
49
89
3
182
27
16
27
29
1.97
14045832--14045994
42
3.7
43
80
9
161
29
14
26
28
1.95
14050186--14050320
39
3.4
39
74
11
116
28
27
20
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14053107--14053228
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2.2
55
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2
138
17
27
26
28
1.97
14059169--14059204
14
2.6
14
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0
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0
25
0
75
0.81
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5
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5
100
0
56
57
0
0
42
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23
1.9
23
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0
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29
2
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61
1.34
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23
1.9
23
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0
70
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4
2
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1.28
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2
2
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1.18
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0
0
59
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1.9
18
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2
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21
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1.91
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21
3.2
21
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0
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22
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1.93
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16
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40
6
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53
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23
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23
100
0
98
38
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14
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1.83
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15
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0
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39
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0
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25
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2
18
0
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2.5
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18
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18
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21
1.9
22
90
9
68
16
4
14
64
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14099522--14099565
21
2.1
21
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8
54
25
0
11
63
1.27
14100459--14100798
130
2.6
127
81
4
358
29
18
17
34
1.94
14100520--14100893
131
2.9
129
79
5
339
29
17
18
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1.93
14110819--14110843
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5
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0
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0
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0
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0
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0
0
0.90
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95
90
0
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2.4
28
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1.9
20
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0
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0
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1.11
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45
0
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1.09
14122800--14122845
23
1.9
23
86
8
65
36
0
2
60
1.09

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356