Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  74  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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9
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1.9
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49
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181
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15
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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86
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1.99
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2.7
21
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3
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1.17
23396213--23396266
21
2.6
21
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140
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15
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0
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19
19
21
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.0
17
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35
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17
22
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162
43
14
24
17
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23502048--23502288
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3.3
73
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0
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1.95
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150
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11
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30
16
20
33
1.94
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32
16
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31
1.94
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71
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34
16
18
31
1.93
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155
3.6
153
78
11
463
28
16
19
35
1.94
23502974--23503334
154
2.4
150
84
5
459
28
16
22
32
1.96
23502967--23503345
74
5.1
75
82
6
459
27
16
21
34
1.95
23503274--23503589
88
3.6
87
80
5
309
29
15
20
34
1.93
23503274--23503589
175
1.8
175
82
6
417
29
15
20
34
1.93
23504218--23504346
30
4.3
30
95
0
240
26
50
6
17
1.69
23504807--23504934
23
5.5
23
71
12
84
35
6
3
55
1.41
23504882--23504940
25
2.3
26
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8
77
37
5
1
55
1.32
23504936--23505018
25
3.4
23
77
14
78
30
6
6
57
1.47
23505173--23505207
16
2.3
15
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31
5
2
60
1.35
23506127--23506245
25
4.8
25
74
15
102
17
29
18
34
1.94
23506135--23506269
50
2.7
50
79
6
141
18
28
20
33
1.96
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20
2.0
20
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27
25
20
27
1.99
23512489--23512513
9
2.8
9
100
0
50
20
0
8
72
1.10
23512478--23512529
19
2.7
19
69
3
50
40
0
3
55
1.18
23522256--23522349
41
2.3
41
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1
127
31
15
15
36
1.90
23525168--23525203
16
2.2
16
90
0
54
36
0
0
63
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23527097--23527150
23
2.4
23
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6
76
59
7
1
31
1.36
23527100--23527170
3
23.3
3
74
8
63
61
5
1
30
1.27
23527634--23527671
11
3.2
12
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11
60
47
0
52
0
1.00
23528545--23528657
41
2.8
40
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2
190
26
21
23
29
1.99
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186
4.0
186
99
0
1462
28
22
17
31
1.96
23529098--23529367
142
1.9
141
82
6
339
28
22
17
31
1.97
23529284--23529553
142
1.9
141
84
6
357
28
22
17
31
1.97
23528859--23529583
44
15.8
44
75
12
530
28
23
16
31
1.96
23541147--23541200
23
2.4
23
87
6
76
59
7
1
31
1.36
23541150--23541220
3
23.3
3
74
8
63
61
5
1
30
1.27
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11
3.2
12
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11
60
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0
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0
1.00
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3.1
8
100
0
50
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52
12
1.72
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9
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9
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21
70
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2
4
31
1.29
23543281--23543352
10
7.4
10
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20
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2
2
27
1.19
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21
2.3
21
80
13
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68
2
2
27
1.11
23543287--23543334
17
2.6
18
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12
53
64
4
2
29
1.23
23543866--23543904
16
2.2
19
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13
57
25
2
2
69
1.14
23544374--23544414
11
3.7
11
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20
50
36
2
0
60
1.10
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131
2.0
131
93
0
440
35
18
17
28
1.94
23546985--23547016
13
2.4
14
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10
57
56
21
0
21
1.43
23548527--23548960
46
10.0
46
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12
576
22
24
15
37
1.93
23548661--23548947
84
3.4
79
87
11
366
22
24
16
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23548571--23548948
130
3.0
130
93
3
637
22
24
16
36
1.94
23548745--23548960
84
2.6
84
97
0
414
23
25
16
35
1.95
23552549--23552590
21
2.0
21
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7
14
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23
1.64
23554190--23554258
30
2.3
30
92
0
120
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5
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1.68
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2.2
23
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10
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3
0
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23554725--23554856
23
5.6
24
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8
83
35
6
3
54
1.42
23554870--23554936
22
2.9
22
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10
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4
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6
4
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1.45
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4.3
13
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8
51
32
8
1
57
1.40
23554792--23554938
25
5.9
25
73
13
97
31
8
4
56
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356