Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  20  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6837499--6837689
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0
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0
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2.2
29
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0
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93
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3.1
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1.9
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35
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1.80
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28
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2
83
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23
0
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1.55
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2.9
21
81
11
72
33
9
19
37
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6902423--6902573
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2.8
53
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17
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2.0
21
90
0
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21
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1.98
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17
2.8
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0
0
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2.3
31
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30
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0
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0
0
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1.00
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19
21
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1.89
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5.2
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2.2
51
91
0
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1
0
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1.11
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42
2.0
43
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2
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3
4
39
1.40
6951440--6951511
32
2.3
32
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1.57
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1
483
21
21
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51
34
0
0
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86
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231
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12
4
34
1.63
6990021--6990097
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2.4
31
83
14
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1
1
25
1.01
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0
0
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1
0
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1.05
6990736--6990798
24
2.8
22
81
18
76
36
1
0
61
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6991225--6991256
3
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3
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0
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65
0
3
31
1.08
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2.7
12
90
0
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0
62
0
0.95
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199
27
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26
29
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2.0
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2.8
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192
26
18
26
28
1.98
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2.0
48
83
4
122
25
16
28
29
1.97
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168
2.1
168
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486
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1.54
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26
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3
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1.66
7018430--7018524
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74
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17
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27
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23
1.94
7023984--7024367
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10
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37
15
23
23
1.93
7023935--7024326
84
4.6
84
91
3
590
36
16
23
23
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7024520--7024552
17
2.0
17
94
5
59
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0
15
36
1.45
7029023--7029080
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2.5
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10
62
48
0
0
51
1.00
7029024--7029100
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2.1
36
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111
51
0
0
48
1.00
7029666--7029690
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12.5
2
100
0
50
0
0
48
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98
96
0
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34
15
22
28
1.94
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37
3.5
37
96
0
231
37
17
19
26
1.93
7056862--7056897
17
2.1
17
94
0
63
44
5
22
27
1.75
7060148--7060276
46
2.8
46
95
0
222
29
29
21
19
1.98
7061912--7061994
25
3.2
25
68
18
62
21
22
19
36
1.95
7062008--7062136
25
5.2
24
71
7
62
19
24
20
34
1.96
7062027--7062092
25
2.7
25
78
2
71
22
27
18
31
1.97
7061982--7062098
24
4.8
25
74
3
87
20
27
18
33
1.96
7063971--7064004
16
2.2
16
89
5
52
47
8
5
38
1.59
7071872--7071903
7
4.6
7
96
0
55
25
0
9
65
1.22
7071859--7071903
14
3.1
15
84
9
58
26
0
6
66
1.16
7072902--7072995
27
3.5
26
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12
75
52
1
2
44
1.20
7072950--7072996
10
4.5
10
75
19
51
51
2
0
46
1.13
7072960--7073043
33
2.5
34
82
7
100
53
4
1
40
1.30
7076987--7077118
69
1.9
67
90
6
212
43
8
21
27
1.81
7077862--7077898
18
2.1
18
100
0
74
29
0
5
64
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7085651--7085756
44
2.4
44
82
0
131
29
22
15
33
1.94
7085703--7085814
58
1.9
58
92
0
188
25
24
18
31
1.98
7090112--7090146
17
2.1
17
94
0
61
48
2
5
42
1.41
7092783--7092841
28
2.1
27
81
9
66
42
0
1
55
1.09
7095508--7095535
14
2.0
14
100
0
56
21
14
0
64
1.29
7097208--7097258
20
2.4
21
83
6
59
37
5
3
52
1.44
7101929--7101973
21
2.1
22
83
4
56
66
0
6
26
1.16
7106731--7106773
9
4.7
9
78
16
52
53
0
0
46
1.00
7106708--7106783
28
2.6
28
82
14
91
53
0
2
43
1.14
7109233--7109262
2
14.5
2
93
6
51
46
0
3
50
1.18
7112294--7112325
3
10.7
3
100
0
64
34
0
0
65
0.93
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11
2.9
12
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17
52
78
0
21
0
0.75
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23
3.4
23
79
6
88
43
21
24
11
1.85
7133858--7133953
46
2.1
46
82
0
111
42
21
22
12
1.87
7137792--7137831
18
2.2
18
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0
71
17
25
20
37
1.94
7141170--7141244
26
2.7
29
78
16
95
26
50
0
22
1.49
7141152--7141240
29
3.2
28
80
13
87
29
50
1
19
1.55
7141631--7141664
11
3.0
11
91
4
50
32
0
0
67
0.91
7141631--7141662
15
2.1
15
94
5
55
31
0
0
68
0.90
7141520--7141653
63
2.2
63
82
8
159
26
4
5
63
1.37
7142236--7142303
30
2.3
30
82
5
75
48
5
17
27
1.70
7144706--7145160
46
10.0
46
93
1
738
37
15
23
22
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7145965--7146208
126
1.9
126
94
0
425
28
17
14
38
1.90
7149714--7149758
21
2.1
21
91
0
72
37
22
24
15
1.93
7152301--7152368
14
5.2
14
75
21
60
77
1
20
0
0.84
7152331--7152378
17
2.7
18
80
3
53
77
2
18
2
0.97
7153859--7153945
46
1.9
46
81
4
106
28
22
24
24
1.99
7153636--7154076
179
2.5
176
89
2
695
30
22
22
24
1.99
7153922--7154395
132
3.6
132
82
5
568
30
22
22
24
1.99
7154563--7155124
85
6.6
85
85
3
709
29
23
25
20
1.99
7154563--7155121
172
3.3
171
89
2
815
29
23
26
20
1.99
7154392--7155125
87
8.5
85
80
6
666
31
22
23
21
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356