Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  52  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17011748--17011807
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22
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53
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60
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
5
3
62
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.27
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17219172--17219197
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2
6
49
1.41
17231802--17232094
120
2.4
120
92
2
482
42
2
5
50
1.36
17231923--17231957
18
2.0
17
88
5
52
40
0
0
60
0.97
17232043--17232077
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
17232031--17232305
147
1.9
149
96
1
509
47
2
3
46
1.33
17232190--17232224
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
17232386--17232480
45
2.1
45
86
1
129
32
26
5
35
1.79
17234137--17234195
26
2.3
25
80
8
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40
1
3
54
1.27
17243583--17243621
14
2.8
14
88
7
53
41
5
17
35
1.72
17244065--17244121
15
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15
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17
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47
0
3
49
1.18
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14
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14
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10
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0
0
53
1.00
17244198--17244257
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2.8
22
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51
0
0
48
1.00
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2.0
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11
14
33
1.83
17259709--17259782
28
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28
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2
85
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22
1.94
17263878--17263926
18
2.9
17
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19
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40
22
0
36
1.54
17264995--17265037
17
2.6
17
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7
54
6
13
9
69
1.35
17271242--17271275
17
2.0
17
94
0
59
67
0
5
26
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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3
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7
52
35
0
3
60
1.15
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29
2.9
29
78
15
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34
7
7
51
1.57
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30
2.0
30
100
0
120
26
13
16
43
1.85
17279092--17279172
22
3.6
22
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15
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32
12
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2.0
33
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2.0
52
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0
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18
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1.23
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2.0
37
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10
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20
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2.3
18
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5.0
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0
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24
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24
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2
137
36
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13
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1.91
17298425--17298587
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2.2
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5
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34
27
12
24
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17298453--17298587
48
2.8
48
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7
157
35
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17299796--17299881
46
1.9
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90
4
136
32
13
24
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1.94
17299798--17299922
44
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135
34
14
23
28
1.94
17304107--17304172
32
2.1
32
100
0
132
31
12
15
40
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17307745--17307776
14
2.3
14
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0
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34
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21
37
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17313225--17313262
20
1.9
20
89
10
60
57
2
2
36
1.26
17313246--17313301
27
2.1
26
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5
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39
1.42
17322019--17322084
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2.0
33
100
0
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15
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2.0
21
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0
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2.1
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2.0
21
90
0
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13
47
0
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1.43
17354954--17355018
23
3.0
23
73
8
64
41
21
18
18
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356