Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  169  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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29
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18
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
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1.98
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19
27
24
1.98
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22
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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62
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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34
1.78
54912135--54912187
25
2.3
24
78
15
58
52
13
0
33
1.40
54912851--54912900
5
9.6
5
91
8
82
58
0
0
42
0.98
54912912--54912952
16
2.6
16
84
3
57
51
0
0
48
1.00
54912692--54913102
221
1.9
223
80
5
492
44
6
2
45
1.44
54913874--54913918
19
2.4
19
85
7
56
24
22
11
42
1.86
54932353--54932852
89
5.6
89
73
10
347
33
16
19
29
1.94
54932358--54933016
44
14.6
44
73
7
387
33
16
19
30
1.95
54932577--54932673
51
1.9
51
82
4
124
35
17
17
29
1.93
54932529--54932721
96
2.0
96
79
7
205
33
15
20
30
1.94
54932398--54932990
229
2.6
227
81
3
697
33
16
19
29
1.94
54934454--54934486
12
2.8
12
90
4
50
27
3
3
66
1.21
54934579--54934722
64
2.4
60
79
10
161
31
7
2
59
1.37
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2.0
15
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16
0
6
77
0.97
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35
2.1
35
85
9
98
28
6
21
43
1.78
54947854--54947887
11
3.1
11
86
0
50
38
0
2
58
1.13
54964637--54964672
16
2.2
16
100
0
72
38
0
30
30
1.58
54965622--54965659
19
2.0
19
94
0
67
34
10
13
42
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
54971301--54971361
30
2.0
30
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0
86
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6
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31
1.80
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27
7.6
27
93
3
333
26
14
28
30
1.95
54973724--54973930
55
3.8
55
96
0
351
26
14
28
30
1.95
54981387--54981561
46
3.8
46
76
15
182
21
20
28
29
1.98
54981384--54981554
92
1.8
93
91
3
283
22
20
28
28
1.98
54984648--54984915
26
10.3
26
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4
191
32
29
15
22
1.95
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4.5
52
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4
215
33
29
16
21
1.95
54984681--54984894
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2.7
78
78
2
225
34
29
15
20
1.93
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32
23
13
30
1.93
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4.4
49
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183
24
28
20
26
1.99
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2.0
97
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26
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20
25
1.99
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4.0
50
80
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195
25
17
27
28
1.98
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15
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7
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1.54
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25
20
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26
1.99
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26
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6
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31
25
13
28
1.94
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2.9
52
80
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151
32
24
12
30
1.92
55010849--55011066
78
2.8
78
75
3
197
32
25
13
28
1.94
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13
2.0
13
100
0
52
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30
0
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23
1.9
25
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8
69
52
0
2
45
1.13
55022706--55022761
27
2.1
27
93
0
94
37
17
17
26
1.93
55044287--55044391
39
2.7
39
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133
24
23
20
30
1.99
55056376--55056670
50
5.9
50
91
0
446
29
20
27
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
55058530--55058842
47
6.7
45
72
17
214
27
18
29
24
1.98
55058625--55058730
44
2.4
42
84
10
124
27
17
28
26
1.98
55075422--55075458
14
2.6
14
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0
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21
32
13
32
1.92
55077088--55077128
20
2.0
20
85
0
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29
19
14
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0
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0
0
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4
4
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24
24
26
24
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25
2.00
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28
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2.0
19
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5
58
27
0
0
72
0.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356