Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  341  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1
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1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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2.8
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4
2
57
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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3
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1.9
22
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5
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23
5
33
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109300203--109300241
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2.0
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23
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22
25
1.84
109312031--109312060
15
1.9
16
93
6
53
50
3
6
40
1.45
109313051--109313117
31
2.2
31
83
0
80
59
17
4
17
1.53
109313365--109313422
21
2.8
20
79
10
62
1
46
20
31
1.61
109318970--109319189
9
23.9
9
73
9
131
38
0
12
48
1.48
109318970--109319185
18
11.7
18
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150
37
0
12
48
1.47
109319023--109319189
27
6.0
27
77
10
147
38
1
13
47
1.50
109318946--109319167
114
1.9
114
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304
38
0
12
48
1.48
109319300--109319355
15
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15
78
21
73
53
0
0
46
1.00
109319532--109319599
24
2.8
24
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20
27
1.78
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2.5
372
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0
1754
38
10
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35
1.82
109324010--109324039
14
2.1
15
93
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36
0
13
50
1.42
109325949--109326041
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28
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0
26
48
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109326331--109326588
41
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16
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25
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2.2
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3
78
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1.94
109340058--109340091
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2.7
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23
0
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38
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15
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66
7
0
26
1.19
109344063--109344101
19
2.0
20
90
5
62
71
7
0
20
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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40
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2.0
24
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0
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4
0
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1.12
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22
2.5
22
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1
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4
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1.37
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2.4
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3
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1.32
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22
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0
0
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0
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25
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0
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48
19
1.64
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2.6
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4
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1.22
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3
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1.14
109415754--109415825
27
2.7
27
100
0
144
29
33
22
15
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109417019--109417080
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18
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0
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2.1
16
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0
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11
23
1.87
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1
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1.9
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0
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0
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1.65
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26
0
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3.2
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0
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17
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1
59
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356