Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          353   354   355   356   

This is table  209  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68266963--68267115
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0
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1.9
255
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6.7
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0
0
44
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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1
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2.0
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1.9
175
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1.95
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2.3
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1.92
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2.7
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24
1.96
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34
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2.1
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134
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86
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13
4.9
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24
2.2
24
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67
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37
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16
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0
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12
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1.87
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26
2.1
26
96
0
101
32
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14
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2.1
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56
11
25
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22
1.86
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4.0
43
83
4
211
22
29
20
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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2.0
40
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2
39
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17
1.9
17
88
11
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12
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13
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0
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52
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2
9
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1.44
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15
2.1
15
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56
0
6
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1.33
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19
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1.97
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1.97
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5
92
36
20
8
34
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68479716--68479841
43
2.9
43
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0
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20
19
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1.97
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3.3
26
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25
12
28
1.92
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43
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0
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13
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0
50
24
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32
40
1.73
68498120--68498299
28
6.5
28
94
0
290
26
12
27
33
1.93
68506382--68506563
28
6.5
28
94
0
294
28
12
26
32
1.93
68520210--68520648
47
9.3
47
94
1
698
32
8
30
28
1.87
68520767--68520845
37
2.1
37
83
0
95
25
18
30
25
1.98
68530039--68530065
8
3.4
8
100
0
54
0
25
22
51
1.48
68530773--68530810
16
2.4
16
90
0
58
10
5
36
47
1.61
68535271--68535391
57
2.1
59
82
3
147
26
18
7
47
1.74
68539778--68539829
26
2.0
26
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0
95
42
9
11
36
1.74
68543751--68543803
26
2.0
27
96
3
99
32
18
15
33
1.92
68545386--68545607
46
4.8
46
82
10
274
20
19
29
30
1.97
68545383--68545607
93
2.4
93
88
6
325
20
19
29
30
1.97
68559291--68559478
40
4.7
40
92
0
324
25
28
22
24
1.99
68562297--68562333
8
4.6
8
100
0
74
48
13
0
37
1.43
68565603--68565663
30
2.1
29
90
3
95
26
18
21
34
1.96
68566935--68567063
49
2.6
50
79
7
147
27
19
28
24
1.99
68579738--68579770
8
4.1
8
92
0
57
48
24
24
3
1.65
68580016--68580080
28
2.3
28
94
0
112
33
27
7
30
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68580186--68580275
28
3.2
27
79
7
92
23
23
21
32
1.98
68580196--68580286
27
3.2
28
76
7
78
25
25
17
31
1.97
68581277--68581323
20
2.3
20
85
0
58
53
4
4
38
1.40
68587909--68587973
28
2.3
28
92
5
105
33
26
7
32
1.85
68588079--68588168
28
3.2
27
84
7
110
21
24
22
32
1.98
68588089--68588179
27
3.2
28
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4
94
23
26
18
31
1.97
68588079--68588193
55
2.1
56
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8
137
20
24
20
34
1.96
68589484--68589599
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2.8
42
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0
169
30
19
23
26
1.98
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3.5
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1
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32
1.56
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15
2.0
15
100
0
60
0
46
13
40
1.43
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14
2.1
14
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6
51
58
6
0
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12
2.2
12
100
0
52
30
26
7
34
1.85
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9
34.4
9
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19
123
37
1
13
46
1.54
68595572--68595621
15
3.2
15
78
18
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2
12
50
1.51
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5.8
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15
268
37
1
13
47
1.53
68595539--68595821
74
3.9
73
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6
447
37
2
13
46
1.56
68595757--68595883
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2.6
49
93
2
213
40
0
11
47
1.40
68595804--68595889
40
2.2
40
81
12
97
39
0
11
48
1.40
68596020--68596268
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2.8
91
90
3
396
53
4
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35
1.49
68600741--68600793
26
2.1
26
92
3
90
50
3
5
39
1.44
68600744--68600801
16
3.4
17
76
9
55
46
3
5
44
1.42
68601182--68601309
14
8.7
14
68
9
58
46
28
0
24
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68601143--68601231
37
2.4
37
81
3
99
42
31
2
23
1.66
68601179--68601236
22
2.6
22
77
0
62
46
31
0
22
1.52
68601249--68601309
14
4.4
14
74
0
59
45
29
1
22
1.62
68601627--68601761
41
3.3
41
88
1
189
30
19
20
29
1.97
68603548--68603642
50
1.9
50
89
4
147
24
27
18
29
1.98
68608741--68608834
26
3.6
27
80
7
77
41
23
7
27
1.81
68608760--68609052
27
11.0
26
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9
135
42
21
6
29
1.78
68608792--68609136
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248
42
20
6
29
1.78
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4.1
77
81
8
317
43
21
6
29
1.77
68609372--68609494
41
3.0
41
85
0
165
23
21
26
28
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356