Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          353   354   355   356   

This is table  311  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101003905--101004015
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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220
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24
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30
1.97
101078883--101080030
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24
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2.0
165
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2.0
371
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1312
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21
17
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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205
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0
10
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0.87
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2
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1.81
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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5
54
45
0
0
54
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101116569--101116631
29
2.1
30
88
2
92
33
4
7
53
1.51
101116569--101116640
30
2.4
29
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31
5
6
55
1.50
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21
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20
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35
39
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2.0
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0
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30
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0
1
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0.94
101135020--101135055
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3
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0
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0
35
0
64
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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21
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128
1.9
128
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370
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1.87
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23
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24
2.0
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101170857--101170902
22
2.0
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0
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1.89
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1.99
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28
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1.99
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0
188
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1.99
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29
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1.98
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0
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19
0
0
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0.71
101207439--101207475
19
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19
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0
0
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0
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1.24
101218061--101218167
44
2.4
45
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3
119
29
21
16
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101237475--101237523
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2.5
20
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26
4
4
65
1.29
101237473--101237559
9
9.1
9
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2
2
63
1.19
101237482--101237559
29
2.7
29
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2
2
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1.22
101239803--101239836
17
2.0
17
100
0
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22
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2.0
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1.59
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2.6
39
85
0
130
19
27
27
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356