Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  81  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25442683--25442719
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25550005--25550051
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3.4
31
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19
20
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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2.2
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2.4
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18
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146
86
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16
19
33
1.94
25586303--25586912
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8.3
75
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758
30
16
19
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1.94
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222
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2.4
14
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9
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373
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16
18
37
1.92
25586839--25587170
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178
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452
28
17
18
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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3.3
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4
6
58
1.43
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25
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3.9
177
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1
902
29
16
25
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25635156--25635258
44
2.3
45
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5
111
33
18
21
27
1.96
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12
2.6
13
85
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21
0
0
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5
2
38
1.39
25648143--25648194
24
2.2
24
82
6
61
38
23
3
34
1.73
25659730--25659917
49
3.8
49
80
5
234
27
17
25
29
1.97
25659725--25659912
100
1.9
100
90
0
304
26
18
25
29
1.98
25666438--25666518
36
2.2
38
93
6
148
24
14
2
58
1.49
25667303--25667369
20
3.4
19
89
4
89
37
10
20
31
1.87
25667419--25667513
26
3.8
26
89
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135
27
22
25
25
2.00
25669036--25669219
64
2.8
64
80
7
201
23
30
16
29
1.96
25671462--25671494
17
1.9
17
100
0
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25692017--25692187
93
1.8
93
88
0
261
23
21
26
28
1.99
25695622--25695660
14
2.9
13
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7
51
17
10
10
61
1.55
25700580--25700609
14
2.1
14
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0
51
46
36
0
16
1.47
25714923--25715054
6
21.8
6
70
16
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50
15
15
19
1.79
25714923--25715054
30
4.4
30
78
8
133
50
15
15
19
1.79
25714946--25715028
36
2.3
36
91
0
130
51
15
13
19
1.75
25714988--25715054
25
2.7
25
88
2
100
47
14
16
20
1.82
25715172--25715237
27
2.5
26
85
7
87
37
22
22
16
1.93
25715172--25715245
27
2.8
27
78
13
82
36
21
24
17
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25715196--25715253
27
2.1
27
84
6
73
36
27
20
15
1.93
25715558--25715637
27
3.0
26
83
7
90
35
22
22
20
1.96
25715835--25715922
27
3.3
27
82
3
106
26
18
19
36
1.94
25715927--25716308
27
14.2
27
82
5
479
40
10
22
26
1.86
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22
2.4
22
96
0
97
28
33
13
24
1.93
25724812--25724865
28
2.0
27
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3
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18
20
25
35
1.95
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3.9
23
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1
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39
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17
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1.91
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23
2.2
23
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0
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11
25
1.80
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515
2.0
516
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0
1874
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11
34
1.87
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2.1
15
94
0
55
0
31
0
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0.90
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2.8
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10
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4
20.8
4
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15
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2
25
3
68
1.16
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25
3.4
24
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2
25
3
68
1.17
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6
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0
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39
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0
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30
29
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20
1.97
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41
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1.96
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7
6.7
7
80
0
58
27
0
25
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1.53
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14
3.7
14
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0
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28
0
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7
16.7
7
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24
0
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39
1.56
25771738--25771825
21
4.2
20
75
15
79
23
0
34
42
1.55
25771738--25771825
28
3.1
27
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10
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23
0
34
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1.55
25776260--25776303
22
2.0
22
86
0
61
43
0
0
56
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25782412--25782445
18
1.9
18
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5
61
55
5
11
26
1.58
25783157--25783216
10
6.0
10
83
11
70
66
3
8
21
1.33
25783900--25783980
40
2.0
40
87
0
117
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17
1.93
25792745--25792850
25
4.2
25
79
0
95
21
23
17
36
1.95
25792735--25792850
50
2.3
50
84
0
151
21
24
17
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1.94
25801174--25801213
20
2.0
21
90
5
64
22
27
20
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1.98
25801894--25801980
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2.0
43
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108
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1
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2.0
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55
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30
1.97
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2.2
19
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2
2
19
1.01
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13
1.9
13
100
0
50
20
24
8
48
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356