Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  252  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
110
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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2.0
23
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1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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(0-2)
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44
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.0
36
100
0
144
22
11
11
55
1.66
82860324--82860366
17
2.5
17
88
0
68
37
0
20
41
1.53
82862731--82862864
41
3.1
41
63
22
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35
23
14
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1.93
82862710--82862943
88
2.7
88
92
0
378
31
25
15
27
1.96
82862964--82863193
45
5.2
45
85
5
290
24
26
18
29
1.98
82867273--82867302
14
2.1
14
93
0
51
46
3
6
43
1.46
82870308--82870368
26
2.3
26
86
8
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27
8
27
36
1.85
82871420--82871496
27
2.7
29
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64
0
31
3
1.11
82871419--82871490
39
1.9
40
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11
98
65
0
30
4
1.12
82872371--82872399
15
1.9
15
100
0
58
58
0
0
41
0.98
82872378--82872468
27
3.1
28
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20
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4
1
38
1.27
82874147--82874203
29
2.0
29
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1
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1.23
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23
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1.47
82879204--82879260
3
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3
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1
0
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1.05
82879219--82879260
21
2.0
20
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66
2
0
30
1.04
82879204--82879260
29
1.9
30
82
10
73
63
1
0
35
1.05
82879225--82879269
17
2.6
18
82
13
58
66
2
2
28
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82879216--82879269
23
2.4
22
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14
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1
1
29
1.12
82879420--82879532
3
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3
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15
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60
2
4
32
1.31
82881518--82881552
14
2.5
14
100
0
70
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5
20
17
1.60
82881215--82881876
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7.7
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10
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16
28
1.92
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14
1.9
14
100
0
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7
14
14
1.51
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163
4.6
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907
36
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16
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1.93
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8
240
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18
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1.92
82881857--82882022
90
1.9
88
88
7
255
36
17
17
28
1.93
82881532--82882267
325
2.3
314
86
6
1009
36
18
16
28
1.93
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73
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259
34
18
16
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1.93
82882030--82882265
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3.0
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18
15
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1.91
82882112--82882265
73
2.1
72
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4
222
37
18
16
27
1.92
82892612--82892660
18
2.5
20
75
18
50
61
8
0
30
1.25
82893030--82893074
18
2.4
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20
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0
4
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2.3
24
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50
5
5
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17
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2
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3
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3
71
17
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3
5
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1.35
82894692--82894758
23
2.9
23
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22
2
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37
1.70
82905661--82905694
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2.6
13
95
0
59
32
32
29
5
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82911983--82912034
25
2.1
25
89
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79
28
19
21
30
1.97
82911994--82912059
25
2.6
25
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0
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22
21
27
28
1.99
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10
3.5
10
92
7
63
30
19
16
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82913700--82913763
32
2.0
32
100
0
128
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31
9
31
1.88
82919343--82919402
31
1.9
31
93
0
102
23
23
16
36
1.94
82919651--82919745
25
3.8
25
94
0
154
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22
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1.99
82919790--82919827
10
3.7
10
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31
18
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1.92
82933843--82933920
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2.7
29
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24
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1.98
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4.2
40
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28
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1.99
82936854--82936887
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0
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1.99
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13
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9
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47
14
2
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1.60
82947562--82947734
93
1.9
93
92
2
294
28
31
20
19
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356