Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  183  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59295537--59295680
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0
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26
27
1.99
59303537--59303680
78
1.8
77
82
5
182
26
20
26
27
1.99
59303789--59303858
35
2.0
35
100
0
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0
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102
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17
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0
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2.0
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2.2
25
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5
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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0
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59330246--59330361
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10
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2.8
29
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1.9
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30
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2.1
16
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1
693
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22
17
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1.97
59335886--59336310
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0
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60
5
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3
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30
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2.0
28
85
7
76
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3
1
36
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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54
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2
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1.25
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56
2.7
56
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2
180
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13
21
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1.91
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1
1
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100
0
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19
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2.0
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0
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0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59401291--59401347
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1
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2.0
15
93
0
51
43
6
16
33
1.74
59405999--59406033
17
2.1
17
88
0
52
68
2
0
28
1.04
59406500--59406534
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16
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0
70
62
17
0
20
1.32
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20
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20
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0
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47
2
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36
1.56
59413447--59413500
22
2.5
22
87
6
74
37
0
1
61
1.07
59413577--59413601
13
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13
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52
0
0
48
1.00
59413753--59413792
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3.0
13
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7
25
0
1.16
59414676--59414792
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38
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1.99
59416173--59416224
25
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25
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7
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1.71
59419912--59419988
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127
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14
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0
0
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0.82
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48
7.9
47
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27
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29
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1.98
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2.0
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1.98
59431384--59431640
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329
26
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1.98
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94
1.8
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5
209
23
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28
1.99
59442558--59442719
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23
27
18
30
1.98
59448966--59449004
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1.9
20
94
5
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15
25
41
17
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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48
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3
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28
1.99
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28
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27
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11
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0
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1.03
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0
2
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8
78
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70
0
2
27
1.01
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1
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1.17
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0
2
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1.04
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0
2
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1.01
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1.16
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0
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0
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0
0
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2.3
20
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16
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48
1.34
59482648--59482694
16
2.9
16
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12
53
42
8
0
48
1.33
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172
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17
29
24
1.97
59491968--59492229
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1.9
140
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1.97
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39
2.6
41
76
11
107
18
26
40
14
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59497801--59497842
18
2.3
18
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0
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26
14
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26
1.94
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158
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19
29
24
1.98
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47
5.7
45
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193
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24
1.98
59499428--59499694
140
1.9
141
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8
339
27
18
28
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1.98
59501678--59501751
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37
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0
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0
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0
20
0.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356