Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  302  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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21
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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1.92
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33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
98617951--98618413
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52
3.9
52
76
8
174
31
21
15
31
1.95
98630981--98631172
97
2.0
97
85
4
262
39
18
19
23
1.93
98631115--98631276
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2.2
74
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2
189
38
16
20
24
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98631077--98631336
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25
1.92
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13
2.8
13
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4
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62
0
8
28
1.24
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17
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16
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0
8
29
1.26
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16
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0
6
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1.27
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29
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29
1.45
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14
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15
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57
0
3
39
1.14
98648513--98648550
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20
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7
1.07
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1.92
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30
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0
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31
0
21
46
1.57
98675171--98675298
57
2.2
57
85
0
175
31
0
21
46
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.9
241
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0
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18
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0
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0
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3
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3
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1.40
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0
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21
25
1.98
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3
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21
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28
1.99
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22
21
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28
1.99
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0
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0
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0
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0
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3.3
15
82
17
61
76
0
23
0
0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98741240--98741293
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0
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0
0.76
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1
5
69
1.19
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2.2
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10
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12
11
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1.78
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5.4
53
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21
25
1.98
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2.6
86
91
2
362
30
23
22
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356