Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          353   354   355   356   

This is table  205  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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67024836--67024987
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162
28
15
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1.96
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29
1.96
67032881--67033003
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16
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26
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67056916--67057090
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15
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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1.94
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30
1.98
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19
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1.98
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2.0
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23
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2
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1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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2.0
20
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1.96
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27
14
26
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
7
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3
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0
0
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24
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34
1.72
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28
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29
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0
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17
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2
0
41
1.13
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1.98
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23
20
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28
1.99
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28
2.1
28
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5
97
41
1
6
50
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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19
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3.6
39
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203
39
10
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1.78
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12
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0
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26
29
41
2
1.70
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48
10.0
46
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14
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1.95
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1.96
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1.95
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1.99
67310553--67310777
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22
28
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1.99
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22
23
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26
2.00
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277
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26
2.00
67318313--67318527
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1.8
116
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22
23
26
26
2.00
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2.7
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27
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1.99
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26
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2.0
85
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0
0
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0
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0
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19
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2.0
40
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0
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16
8
32
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67359264--67359340
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30
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29
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59
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2.7
79
82
6
239
23
22
28
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356