Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  16  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5687547--5687669
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0
1
59
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
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2.1
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55
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25
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25
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3.4
92
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42
13
23
20
1.88
5772279--5772588
138
2.2
138
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1
469
42
13
23
20
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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22
1.99
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3.1
26
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3
72
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114
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11
46
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5833214--5833245
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0
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0
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65
2
2
29
1.18
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31
2.0
31
93
3
106
31
3
8
57
1.44
5853081--5853114
12
2.8
12
90
0
50
67
0
0
32
0.91
5853849--5853894
20
2.4
18
82
10
56
71
0
8
19
1.11
5853898--5853929
8
4.0
8
100
0
64
50
0
0
50
1.00
5854363--5854949
89
6.6
89
74
12
307
29
8
10
51
1.65
5854625--5854948
92
3.6
88
79
6
247
29
9
9
52
1.64
5854361--5854946
84
6.6
87
73
10
242
30
8
10
51
1.65
5866412--5866468
14
4.1
14
79
4
62
38
5
21
35
1.76
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19
2.0
20
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57
0
0
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0.98
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2.0
22
100
0
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18
4
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2.0
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20
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17
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1.94
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3.0
81
93
1
418
36
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25
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1.81
5881790--5881819
13
2.3
13
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0
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0
23
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1.50
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0
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0
0
14
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0.61
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6
5.2
6
96
0
53
0
19
35
45
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5896419--5896650
117
2.0
116
96
2
432
37
0
9
53
1.39
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21
2.1
21
95
0
79
29
29
6
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1.83
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5.4
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15
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35
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25
18
1.95
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16
2.1
16
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0
20
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0
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1.82
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2.5
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0
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1.97
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1.92
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1.93
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2.0
22
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0
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1.14
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21
2.2
22
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1.94
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1.93
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0
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43
0
1
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1.10
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12
4.5
12
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42
0
1
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1.10
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19
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13
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0
0
28
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12
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15
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0
0
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2.1
22
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0
0
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1.50
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2.0
99
94
0
345
35
21
10
33
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5942807--5942849
21
2.0
21
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8
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4
6
41
1.51
5943193--5943273
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2.3
35
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0
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1.62
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23
2.0
23
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0
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24
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1.70
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0
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0
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0
0
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0
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15
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0
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1.9
35
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3
91
32
10
11
44
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356