Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  187  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60758234--60758296
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2.2
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225
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200
24
20
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1.99
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4.7
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27
20
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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20
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25
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138
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2.0
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2.0
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48
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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5
260
24
20
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61048507--61048769
40
6.7
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351
25
27
21
25
1.99
61048507--61048769
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27
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25
1.99
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100
0
58
20
0
0
79
0.74
61067000--61067081
26
3.2
26
96
0
155
36
26
6
30
1.81
61075350--61075395
21
2.2
21
84
3
58
41
2
4
52
1.33
61075386--61075473
29
3.1
30
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18
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1
1
40
1.14
61075424--61075457
17
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18
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5
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58
0
0
41
0.98
61075545--61075602
19
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18
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9
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62
1
0
36
1.06
61075596--61075640
23
2.0
23
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57
0
2
40
1.11
61075667--61075764
23
4.2
24
73
18
68
70
6
5
18
1.27
61075916--61075951
19
1.9
19
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5
0
52
1.24
61088131--61088401
48
5.7
46
81
11
209
25
22
30
21
1.99
61088118--61088401
96
3.0
96
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317
26
22
30
21
1.99
61088124--61088401
144
1.9
143
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7
366
25
22
30
21
1.98
61095536--61095720
40
4.7
40
83
6
207
25
27
22
24
2.00
61095536--61095720
79
2.3
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7
207
25
27
22
24
2.00
61103592--61103816
119
1.9
120
84
6
305
25
27
22
24
2.00
61103592--61103816
40
5.7
40
86
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296
25
27
22
24
2.00
61105714--61105926
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2.3
94
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7
258
39
20
9
30
1.84
61106051--61106121
20
3.8
18
73
17
56
71
1
4
22
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61106052--61106121
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9
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15
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71
1
4
22
1.12
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10
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11
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15
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1
0
60
1.04
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21
4.1
21
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13
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35
1
0
63
1.02
61106381--61106468
22
4.1
22
78
11
78
35
1
0
63
1.02
61106378--61106474
11
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10
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1
0
60
1.03
61106488--61106666
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2.0
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1.82
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6
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0
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1.23
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0
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0
0
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29
1.85
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35
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1.86
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12
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0
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0
0.58
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4.7
40
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29
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24
1.99
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27
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24
1.99
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29
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23
1.99
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2.8
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79
11
246
26
21
26
25
2.00
61149322--61149546
40
5.7
40
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7
253
26
21
26
25
2.00
61149325--61149546
119
1.9
120
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10
285
26
21
26
25
1.99
61149375--61149579
79
2.6
79
81
9
197
27
20
26
25
1.99
61153031--61153095
5
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5
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13
4
1
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0.95
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11
4.4
11
81
10
51
15
2
2
80
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61153031--61153086
19
2.9
19
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5
58
12
5
0
82
0.83
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2.5
16
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4
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20
0
2
76
0.90
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2.3
26
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0
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1
0.70
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2.1
15
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0
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1.84
61159790--61160005
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25
26
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26
2.00
61159788--61160012
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5.7
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24
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22
25
2.00
61165487--61165584
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22
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1.91
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58
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22
26
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36
1.92
61167403--61167609
87
2.4
87
78
1
236
22
25
14
37
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356