Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  53  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17356038--17356093
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23
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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17453239--17453396
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13
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57
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1.82
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4
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1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.26
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47
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2.3
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1
57
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1
170
26
24
13
35
1.92
17544900--17545106
47
4.2
48
78
5
177
24
17
27
30
1.97
17547562--17547728
39
4.3
39
89
0
244
25
21
27
25
1.99
17551861--17551962
30
3.4
30
86
0
132
28
21
26
23
1.99
17554175--17554243
17
4.0
17
70
7
59
40
2
1
55
1.24
17554269--17554331
9
7.3
9
69
16
53
57
0
0
42
0.99
17554303--17554452
70
2.1
72
90
5
241
42
3
2
52
1.32
17554346--17554391
18
2.4
19
82
10
58
41
2
0
56
1.11
17554362--17554402
20
2.0
20
85
0
55
53
0
0
46
1.00
17554521--17554592
20
3.5
20
71
16
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50
4
6
38
1.49
17554516--17554601
40
2.1
39
93
4
127
53
3
5
37
1.42
17554536--17554599
20
3.2
20
70
16
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56
3
6
34
1.40
17554971--17555025
20
2.7
20
85
2
74
36
1
0
61
1.06
17554986--17555042
20
3.4
17
77
20
57
36
1
0
61
1.07
17555036--17555079
19
2.7
15
75
24
52
36
6
0
56
1.26
17555441--17555509
22
3.1
21
83
8
75
53
0
0
46
1.00
17555475--17555516
22
2.0
22
85
4
59
64
0
0
35
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17555507--17555554
22
2.1
23
92
3
80
62
0
0
37
0.95
17556653--17556683
15
2.1
15
100
0
62
12
19
19
48
1.81
17559890--17559973
20
4.4
19
73
23
70
33
5
1
59
1.29
17559895--17559944
16
2.8
17
85
11
57
36
8
0
56
1.29
17561678--17561714
18
2.1
18
89
0
56
54
0
24
21
1.45
17564557--17564590
17
2.0
17
94
0
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38
2
11
47
1.55
17565860--17565888
14
2.1
14
100
0
58
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13
20
37
1.91
17571461--17571522
29
2.2
30
81
13
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59
0
0
40
0.97
17574317--17574360
20
2.3
19
80
4
52
45
4
0
50
1.22
17577579--17577824
132
1.9
131
89
5
388
30
19
19
30
1.96
17579916--17580016
48
2.1
48
81
7
116
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3
45
3
1.40
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21
2.0
21
100
0
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47
19
14
19
1.82
17599539--17599573
3
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3
100
0
70
0
31
0
68
0.90
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31
2.0
31
84
9
81
49
1
0
49
1.10
17608958--17608999
22
2.1
19
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13
57
42
4
0
52
1.22
17611329--17611399
18
3.9
18
75
3
70
46
14
8
30
1.74
17611518--17611634
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2.5
47
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5
166
43
22
17
16
1.88
17616050--17616083
17
1.9
17
88
5
50
41
5
14
38
1.70
17622368--17622406
18
2.1
19
85
4
53
33
5
0
61
1.18
17626375--17626451
36
2.1
37
82
2
93
64
1
6
27
1.25
17626705--17626786
37
2.2
38
80
6
87
26
6
2
64
1.29
17627429--17627464
9
3.8
9
92
7
54
30
25
2
41
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17628873--17628905
6
5.5
6
92
0
57
69
27
0
3
1.03
17632637--17632680
18
2.4
18
84
0
61
40
0
2
56
1.11
17632637--17632680
21
2.1
21
91
0
70
40
0
2
56
1.11
17633519--17633554
18
2.0
18
94
0
63
50
0
25
25
1.50
17633519--17633554
12
3.0
12
83
0
54
50
0
25
25
1.50
17633660--17633792
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3.4
38
73
12
110
25
18
26
30
1.98
17634924--17634957
17
2.0
17
100
0
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5
5
29
1.45
17638684--17638753
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2.0
35
100
0
140
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11
5
37
1.64
17644563--17644611
24
2.1
23
85
7
64
57
0
4
38
1.18
17648380--17648464
42
2.0
42
100
0
170
35
7
29
28
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356