Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  356  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114076408--114076460
14
4.0
13
85
4
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3
20
0
75
0.96
114076426--114076470
17
2.6
18
82
7
65
4
20
0
75
0.97
114078450--114078514
31
2.1
31
82
2
78
43
9
6
41
1.61
114100313--114100447
69
1.9
71
82
8
168
33
20
5
40
1.75
114103064--114103110
19
2.3
21
79
13
55
44
4
12
38
1.62
114103418--114103466
5
9.6
5
86
4
71
38
0
4
57
1.18
114104562--114104618
15
3.9
15
93
2
98
36
0
12
50
1.40
114104991--114105076
21
3.9
23
72
15
74
16
20
24
38
1.93
114106552--114106613
24
2.5
25
75
17
65
46
11
11
30
1.75
114107333--114107364
10
3.2
10
95
0
55
59
9
0
31
1.29
114108235--114108280
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
114108242--114108286
23
2.0
23
82
8
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40
13
8
37
1.76
114117093--114117119
12
2.2
12
100
0
54
51
14
7
25
1.68
114117160--114117228
25
2.8
25
80
12
81
53
1
2
42
1.24
114125298--114125347
17
2.9
17
82
11
57
60
0
0
40
0.97
114129227--114129448
109
2.0
109
99
0
435
41
13
11
32
1.81
114153832--114153865
3
11.3
3
100
0
68
35
0
32
32
1.58
114156465--114156499
13
2.7
13
86
0
52
37
2
8
51
1.47
114172163--114172190
3
9.3
3
100
0
56
0
32
0
67
0.91
114184261--114184297
16
2.3
16
95
0
65
24
0
35
40
1.55
114198331--114198376
24
1.9
24
86
8
67
45
2
2
50
1.26
114209293--114209332
20
2.2
19
86
13
57
35
22
0
42
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114210724--114210755
6
5.3
6
96
0
55
3
15
15
65
1.39
114211297--114211333
14
2.6
14
86
0
56
2
27
0
70
1.01
114213568--114213599
15
2.1
15
100
0
64
6
6
25
62
1.42
114214732--114214845
56
2.0
56
100
0
228
42
5
8
43
1.58
114219502--114219602
49
2.1
49
98
0
193
33
18
17
29
1.95
114222650--114222775
61
2.1
61
100
0
252
39
23
4
31
1.76
114233080--114233116
19
1.9
19
88
0
56
56
5
2
35
1.36
114239627--114239667
20
2.0
20
95
0
73
39
4
7
48
1.52
114240863--114240926
31
2.1
31
84
0
83
34
7
10
46
1.68
114242538--114242713
37
4.8
37
96
0
298
39
13
21
26
1.90
114242676--114242799
46
2.8
46
91
3
200
33
16
22
27
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114265466--114265493
2
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2
100
0
56
0
0
50
50
1.00
114265493--114265519
2
13.5
2
100
0
54
48
0
51
0
1.00
114272177--114272210
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2.0
17
94
0
59
23
32
5
38
1.79
114281107--114281247
75
1.9
75
86
2
205
43
12
10
32
1.77
114303731--114303886
78
2.0
78
88
0
231
25
21
24
28
1.99
114310153--114310796
247
2.6
247
96
0
1184
31
17
15
36
1.91
114314034--114314073
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3.0
13
85
14
55
67
0
0
32
0.91
114314034--114314066
12
2.5
13
90
9
50
72
0
0
27
0.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356

The End!