Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  352  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112656328--112656422
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3.2
30
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0
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0
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0
25
0
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0
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0
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2.0
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0
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0
0.63
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33
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43
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93
15
5
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2.0
26
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18
10
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2.4
27
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36
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2.1
22
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60
53
0
2
44
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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5
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2.7
21
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5
1
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1.32
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43
3.6
43
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152
27
21
20
30
1.98
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100
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0
0
100
0.00
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3
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21
3.2
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12
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13
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21
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1.91
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55
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2.0
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14
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39
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2.0
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3
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1.9
18
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52
29
0
5
64
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1.9
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1
0
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3
10
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1.51
112796273--112796318
23
2.0
23
88
12
69
47
10
4
36
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
24
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43
15
5
35
1.70
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1.9
30
88
0
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12
28
35
24
1.91
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22
2.3
22
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15
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59
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3
32
1.33
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0
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127
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2.3
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1
9
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1.46
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46
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9
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1.53
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3.0
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24
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23
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2.0
77
98
0
299
51
6
8
33
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112892420--112892451
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17
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65
3
0
31
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11
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1.50
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2.3
88
92
0
337
30
16
25
28
1.97
112902338--112903138
44
18.4
44
71
11
524
32
17
23
26
1.97
112902347--112903138
132
6.1
132
90
2
1260
32
17
23
26
1.97
112902375--112903138
387
2.0
387
93
0
1305
32
17
23
26
1.97
112903222--112903723
44
11.6
44
70
11
331
35
21
23
19
1.96
112903131--112903818
87
8.0
86
87
4
895
36
20
22
20
1.96
112905507--112905548
3
14.0
3
100
0
84
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0
0
66
0.92
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3
10.0
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100
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0
0
66
0.92
112911881--112911910
14
2.1
14
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0
51
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3
10
0
0.67
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13
3.9
13
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14
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8
72
1.27
112912894--112912936
21
2.0
21
86
0
59
32
6
4
55
1.47
112917047--112917100
26
2.0
26
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10
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72
7
9
11
1.29
112919209--112919277
34
2.0
34
100
0
138
43
20
7
28
1.78
112927507--112927531
12
2.1
12
100
0
50
36
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1.77
112933462--112933500
4
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2
0
25
0.98
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30
2.2
31
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5
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29
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0
65
1.12
112935505--112935574
33
2.1
33
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59
2.1
59
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0
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30
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24
23
1.99
112953539--112953813
144
1.9
144
89
1
426
26
18
23
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112961134--112961205
35
2.1
35
100
0
144
41
5
19
33
1.75
112964253--112964307
21
2.5
23
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63
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9
18
1.49
112972008--112972115
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2.0
53
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0
162
52
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15
20
1.73
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47
2.9
47
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0
254
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1.90
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24
2.1
24
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0
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0
4
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1.12
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25
2.0
25
100
0
100
48
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8
36
1.62
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2.1
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14
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8
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2.0
15
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0
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100
0
50
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0
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1.58
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2.0
15
100
0
60
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20
6
40
1.78
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2.3
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16
27
0
56
1.40
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3.9
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0
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35
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29
1.92
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2.0
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28
0
0
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2.0
118
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0
390
28
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17
22
1.97
113015288--113015392
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2.5
42
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0
147
24
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1.91
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10
5.3
10
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78
0
1
20
0.85
113015497--113015551
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3.5
15
73
22
51
78
0
1
20
0.85
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20
2.9
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16
63
77
0
3
19
0.91
113015496--113015552
26
2.2
27
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9
75
77
0
1
21
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2.0
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464
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13
14
36
1.86
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106
2.0
106
100
0
430
33
17
13
36
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113046932--113046972
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1.9
21
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5
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58
9
7
24
1.55
113050476--113050532
29
1.9
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3
89
29
10
0
59
1.31
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15
3.5
15
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17
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47
0
13
39
1.43
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118
2.0
118
91
0
382
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18
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27
1.97
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2.0
422
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0
1631
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16.3
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0
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0
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11
5.4
11
72
24
56
25
9
8
56
1.59

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356