Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  294  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95566195--95566518
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2.6
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29
1.96
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1.9
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28
1.97
95588571--95588751
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2.2
81
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2
220
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1.97
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1.87
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2
478
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1.87
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25
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2.0
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28
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1.9
237
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28
28
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0
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18
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3
21.0
3
75
18
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1
3
26
1.14
95616267--95616329
18
3.5
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76
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1
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26
1.14
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2.7
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1
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28
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1.74
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45
2.8
44
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8
135
26
26
16
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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2.9
174
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0
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2.5
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101
27
15
29
27
1.96
95640758--95641259
174
2.9
174
97
0
941
29
14
24
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1.94
95643376--95643414
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58
0
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33
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3.1
11
91
0
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1.59
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2.3
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53
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0
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24
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2.1
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27
22
25
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5.7
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17
26
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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94
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106
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27
16
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95782689--95782732
15
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2.1
56
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0
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23
22
1.81
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104
25
15
30
28
1.96
95794650--95794977
174
1.9
174
96
0
602
29
14
24
31
1.94
95797821--95797996
56
3.1
56
98
0
334
45
9
22
22
1.81
95799126--95799310
40
4.6
39
82
7
196
24
22
27
24
2.00
95799126--95799308
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83
7
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25
22
27
24
2.00
95799179--95799343
79
2.1
79
83
8
203
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21
27
24
1.99
95804083--95804268
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2.8
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79
10
202
26
27
16
29
1.97
95810622--95810665
19
2.3
19
96
0
79
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20
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19
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1.84
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25
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25
95
0
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24
21
25
28
1.99
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27
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1.80
95821147--95821276
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5
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7
18
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1.78
95821233--95821333
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27
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32
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1.80
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1.81
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6
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0
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1.91
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1.9
15
100
0
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0
0
17
0.66
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15
2.0
17
88
11
50
56
3
0
40
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
21
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5
55
62
2
5
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1.29
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14
2.4
14
90
9
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63
0
2
33
1.08
95852478--95852525
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3.1
15
85
11
62
64
2
2
31
1.16
95853253--95853302
22
2.3
22
82
6
66
38
16
14
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1.88
95863811--95863940
47
2.8
47
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4
163
23
16
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1.95
95866996--95867202
46
4.4
46
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170
24
29
17
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1.97
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1
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29
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1.87
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1.99
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80
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25
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1.99
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6.6
40
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3
325
24
20
27
26
1.99
95884721--95884979
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3.3
80
85
3
256
25
20
27
25
1.99
95887457--95887719
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6.6
40
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4
273
24
26
23
25
2.00
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2.3
121
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3
305
24
27
22
25
2.00
95888027--95888105
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2.7
29
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27
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2.4
43
100
0
206
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15
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1.94
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10.6
47
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29
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1.86
95889526--95890030
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5.3
95
94
2
845
29
29
8
32
1.86
95889526--95890030
239
2.1
237
94
1
875
29
29
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0
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0
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0
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27
19
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3.6
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19
28
25
1.99
95915090--95915150
30
2.0
30
87
0
86
29
24
4
40
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95919072--95919109
11
3.6
11
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13
62
39
13
18
28
1.88
95919157--95919227
25
2.8
25
82
6
81
26
22
22
28
1.99
95919448--95919530
30
2.7
31
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3
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28
20
27
22
1.99
95921386--95921565
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4.4
40
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5
231
25
26
24
23
2.00
95924532--95924610
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2.1
37
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0
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47
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0
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43
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0
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0
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29
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1.9
24
100
0
92
30
15
13
41
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356