Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  61  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19574071--19574112
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0
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209
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28
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100
0
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0
0
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2.5
261
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1001
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18
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26
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0
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19608314--19608383
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21
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18
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0
18
42
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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30
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5
19
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1.72
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2.6
127
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17
27
1.90
19610982--19611372
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126
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0
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2
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18
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11
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18
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55
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26
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21
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26
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5
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2.3
34
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84
25
7
3
63
1.39
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0
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0
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3
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8
2
60
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
26
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46
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19
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17
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203
2.0
203
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18
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2.0
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2.5
18
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18
13
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19682657--19682819
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3.0
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1.85
19682670--19682819
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5
241
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18
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1.87
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29
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1
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29
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19721100--19721196
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2.4
41
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5
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60
2
6
30
1.32
19721133--19721213
40
2.0
40
85
0
108
61
1
4
32
1.25
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3.6
12
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64
0
0
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0.94
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1
3
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67
7
0
24
1.16
19724358--19724397
21
1.9
21
100
0
80
2
22
5
70
1.19
19724366--19724427
27
2.4
26
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7
81
1
22
3
72
1.08
19724362--19724408
21
2.4
18
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10
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2
23
2
72
1.06
19725886--19725936
5
10.2
5
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23
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35
1
3
58
1.28
19725899--19725941
10
4.3
10
94
5
70
32
0
6
60
1.23
19725999--19726035
17
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18
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58
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0
24
0
0.80
19725996--19726042
23
2.0
22
84
15
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72
0
27
0
0.85
19731978--19732002
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13
100
0
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24
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52
1.70
19732049--19732192
70
2.1
70
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0
270
25
25
25
24
2.00
19734852--19734885
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13
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0
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1.29
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18
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69
1.28
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16
2.1
16
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0
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2.0
19
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1
188
27
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27
25
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19751200--19751246
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2.2
21
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0
85
38
4
4
53
1.40
19751310--19751356
21
2.2
21
92
0
76
40
4
2
53
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19751113--19751468
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3.2
110
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32
6
10
50
1.62
19751421--19751475
21
2.6
21
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0
101
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3
3
58
1.33
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19
2.7
19
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3
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40
3
1
53
1.30
19754254--19754417
90
1.8
90
84
2
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42
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48
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3
0
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1.40
19754444--19754701
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2.8
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29
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18
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1
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1
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2.7
21
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1
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21
25
1.99
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23
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1.99
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123
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84
36
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2.1
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0
0
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5.1
8
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0
18
1.40
19771944--19771987
17
2.6
17
100
0
88
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22
0
20
1.42
19771944--19771988
9
5.2
9
89
10
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22
0
22
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13
2.2
14
94
5
53
0
20
0
80
0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19776082--19776106
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2.1
12
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0
50
52
0
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40
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2.4
17
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0
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10
10
22
1.61
19778296--19778354
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2.0
29
100
0
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2.0
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0
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27
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1.45
19818145--19818203
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2.4
25
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13
70
49
0
3
47
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356