Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  241  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Score
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Indices
Period
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A
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(0-2)
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164
21
19
28
30
1.97
79472998--79473169
93
1.8
93
87
4
258
22
19
28
29
1.98
79475481--79475539
29
2.0
30
86
3
84
28
28
8
33
1.87
79482146--79482203
30
1.9
30
85
0
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27
31
20
20
1.98
79485436--79485518
29
2.9
29
88
0
121
26
28
15
28
1.96
79486854--79486885
16
2.0
16
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0
55
15
6
28
50
1.68
79487113--79487905
48
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48
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15
281
29
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22
41
1.81
79487113--79487947
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6.0
139
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0
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1.80
79488818--79489030
101
2.1
101
91
0
345
28
15
26
29
1.96
79488850--79489028
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5.4
33
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7
137
29
15
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29
1.96
79488946--79489119
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2.0
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4
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1.95
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9
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0
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0
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28
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21
1.98
79514560--79514735
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46
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12
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29
28
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1.98
79515161--79515220
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2.0
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0
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0
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1.88
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52
3.0
52
78
8
167
31
26
15
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
24
2.00
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13
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0
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10
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10
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21
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1.97
79544722--79544782
20
3.0
20
83
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27
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1.95
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100
0
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1.94
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23
1.93
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1.9
20
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2.0
144
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1.98
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2
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18
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52
2
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144
2.0
144
100
0
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1.98
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23
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1.32
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4
8.0
4
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9
50
73
2
0
23
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79561898--79561922
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13
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0
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0
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79563843--79563897
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0.94
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1.93
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20
3.2
20
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16
53
23
21
16
38
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356