Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  215  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70130538--70130596
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38
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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29
1.97
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14
209
20
20
29
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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28
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1.99
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2.0
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100
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0
64
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70381181--70381286
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1.98
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27
18
20
1.96
70398125--70398149
3
8.3
3
100
0
50
0
32
0
68
0.90
70411032--70411248
47
4.6
47
78
10
255
24
17
27
29
1.98
70411079--70411294
93
2.3
93
89
0
324
22
19
28
29
1.98
70410982--70411247
140
1.9
140
92
0
451
23
18
27
29
1.98
70414279--70414345
30
2.3
28
80
10
73
8
16
16
58
1.62
70417075--70417343
46
5.8
46
73
11
217
21
20
28
29
1.98
70417125--70417289
47
3.5
47
78
14
205
22
17
29
30
1.97
70417071--70417336
93
2.9
93
91
0
424
22
20
28
28
1.98
70421395--70421466
34
2.1
34
100
0
144
37
12
0
50
1.41
70421402--70421456
16
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16
73
26
60
36
10
0
52
1.37
70425980--70426032
3
18.3
3
82
7
56
67
0
32
0
0.91
70425980--70426032
17
3.1
17
75
2
52
67
0
32
0
0.91
70426677--70426724
23
2.0
24
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29
22
4
43
1.72
70427173--70427228
21
2.7
21
83
5
69
8
12
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41
1.74
70428004--70428046
22
2.0
22
95
0
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48
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20
13
1.80
70429858--70430075
39
5.5
39
88
1
303
29
28
22
19
1.98
70434441--70434632
40
4.9
40
86
6
254
24
22
27
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
2.0
15
93
0
51
40
36
6
16
1.75
70437123--70437231
48
2.3
48
96
0
200
47
19
11
22
1.80
70437283--70437436
6
24.7
6
70
15
71
55
13
9
21
1.67
70443666--70443823
38
4.1
38
86
3
210
30
25
22
22
1.99
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42
3.9
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160
32
25
15
26
1.96
70452258--70452389
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2.1
62
100
0
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18
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2.1
12
100
0
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30
14
1.94
70463326--70463382
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2.8
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22
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1.96
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49
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150
25
29
18
25
1.98
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22
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1.97
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1.9
139
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21
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11
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2.0
35
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0
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23
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1.84
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26
18
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28
1.98
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48
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228
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18
26
27
1.98
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21
21
28
28
1.98
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93
1.8
93
93
0
299
22
21
28
27
1.99
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27
2.0
27
100
0
110
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0
14
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2.2
67
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8
171
32
18
28
20
1.96
70500333--70500428
48
2.0
48
95
0
174
42
5
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40
1.63
70506161--70506270
23
4.8
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27
21
16
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1.95
70513222--70513343
40
3.0
40
85
0
163
28
28
21
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70521175--70521342
40
4.2
40
80
3
205
27
27
20
23
1.99
70529773--70529875
44
2.4
43
80
1
134
27
17
26
29
1.98
70529786--70529869
43
1.9
44
90
2
134
25
16
27
30
1.97
70529773--70529888
43
2.7
44
76
6
128
26
17
26
29
1.97
70536955--70537142
40
4.7
40
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27
27
20
24
1.99
70544967--70545154
40
4.7
40
87
3
263
27
27
21
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1.99
70546862--70547236
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47
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0
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0
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2.2
34
80
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89
28
25
22
24
2.00
70561920--70562010
27
3.4
26
83
6
110
41
18
12
27
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356