Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: A11 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  71  of  356  ( 42641 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22442011--22442041
16
1.9
16
100
0
62
6
29
0
64
1.18
22449926--22449990
30
2.2
30
83
5
78
44
4
15
35
1.67
22450185--22450233
17
2.6
19
75
21
50
61
0
4
34
1.15
22458775--22459140
173
2.1
173
98
0
705
25
33
24
16
1.96
22463344--22463381
19
2.0
19
89
0
58
65
5
2
26
1.27
22464319--22464375
30
1.9
29
82
10
71
35
1
7
56
1.37
22466441--22466471
7
4.3
7
92
8
53
61
0
0
38
0.96
22466430--22466481
17
3.2
16
76
17
54
65
1
0
32
1.04
22476768--22476926
44
3.6
44
79
7
146
24
20
22
32
1.98
22478742--22478932
43
4.4
44
78
10
189
27
16
26
29
1.97
22483851--22483899
18
2.8
17
84
9
62
12
16
40
30
1.85
22499680--22499827
66
2.2
66
80
5
183
41
1
12
44
1.51
22499690--22499804
33
3.5
33
92
2
187
44
0
14
40
1.52
22499908--22500177
125
2.2
126
86
2
366
37
15
16
31
1.90
22512876--22513051
47
3.7
47
83
3
228
32
30
16
21
1.95
22516468--22516544
24
3.2
24
74
9
77
45
7
6
40
1.59
22516619--22516643
9
2.8
9
100
0
50
56
0
0
44
0.99
22517147--22517195
19
2.6
18
80
6
53
51
4
6
38
1.46
22517312--22517373
23
2.7
23
85
5
72
54
3
6
35
1.42
22517424--22517460
19
1.9
19
88
0
56
56
2
0
40
1.13
22521492--22521525
17
1.9
18
88
5
52
44
0
2
52
1.16
22527549--22527579
15
2.1
15
93
0
53
16
64
19
0
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22528728--22528783
29
1.9
29
96
0
103
35
16
17
30
1.92
22531810--22531845
18
1.9
19
88
5
56
27
27
25
19
1.99
22534364--22534415
17
3.1
17
86
5
70
55
1
1
40
1.22
22538629--22538696
27
2.5
27
82
0
73
26
36
8
27
1.86
22547019--22547077
18
3.2
18
76
11
57
20
3
3
72
1.13
22547069--22547106
15
2.5
15
83
8
51
21
0
7
71
1.11
22548681--22548721
22
1.9
22
95
5
75
60
9
19
9
1.55
22560265--22560305
6
6.7
6
83
5
55
46
17
19
17
1.85
22560288--22560395
45
2.4
44
84
9
146
45
16
14
23
1.84
22560591--22560677
40
2.2
40
85
0
111
40
18
9
32
1.82
22561009--22561054
22
2.1
22
84
8
58
23
19
0
56
1.42
22561568--22561594
12
2.2
12
100
0
54
44
29
0
25
1.54
22564421--22564528
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
22574249--22574281
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
22574577--22574789
46
4.6
46
90
1
311
20
24
13
40
1.89
22589081--22589123
20
2.1
21
83
12
54
67
4
23
4
1.28
22596995--22597041
22
2.1
22
84
0
58
65
6
0
27
1.16
22597665--22597696
10
2.8
12
81
18
50
65
0
0
34
0.93
22599856--22599901
24
2.0
22
83
8
56
43
6
6
43
1.56
22601064--22601149
28
3.0
29
81
5
102
41
4
22
31
1.74
22601179--22601808
193
3.3
192
86
2
852
33
16
21
28
1.95
22602415--22602526
32
3.5
32
84
4
145
35
11
9
42
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22602809--22602852
17
2.5
18
88
3
63
52
36
0
11
1.38
22614624--22614653
13
2.4
13
94
5
53
26
16
10
46
1.78
22619952--22619991
20
2.0
20
85
0
53
45
10
5
40
1.60
22620706--22620781
22
3.4
22
68
13
64
39
6
0
53
1.27
22623566--22623674
54
2.0
55
83
5
141
33
20
9
37
1.84
22624540--22624580
11
3.6
11
87
6
55
56
0
12
31
1.36
22628307--22628352
18
2.5
19
82
10
60
30
0
2
67
1.03
22630272--22630309
20
1.9
20
88
0
58
18
13
31
36
1.89
22632205--22632247
23
1.9
23
85
4
61
41
23
6
27
1.80
22632396--22632442
23
2.0
23
100
0
94
44
17
8
29
1.78
22633158--22633265
20
5.4
20
72
8
76
41
17
7
33
1.77
22633415--22633591
23
7.6
23
80
3
194
26
18
23
32
1.97
22633392--22633591
46
4.3
46
83
5
224
26
18
23
32
1.97
22634658--22634696
3
13.0
3
100
0
78
33
0
0
66
0.92
22636398--22636662
46
5.9
46
85
7
332
22
24
14
38
1.92
22636577--22636652
38
2.0
38
100
0
152
23
26
18
31
1.97
22637867--22637904
19
2.0
19
85
10
51
36
15
5
42
1.70
22639984--22640023
21
1.9
21
84
0
53
32
0
7
60
1.25
22641373--22641436
21
2.8
23
76
11
69
65
1
0
32
1.02
22641402--22641460
17
3.6
16
79
16
59
66
0
0
33
0.92
22642484--22642529
3
15.3
3
100
0
92
0
32
0
67
0.91
22643944--22643994
18
2.8
18
90
0
84
50
5
19
23
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22644515--22644566
25
2.0
26
88
3
79
55
1
5
36
1.35
22646644--22646689
24
1.9
24
90
0
74
43
10
26
19
1.84
22650942--22651005
28
2.3
28
94
2
112
7
35
9
46
1.65
22651396--22651429
10
3.6
9
85
14
50
85
0
8
5
0.75
22656721--22656745
7
3.6
7
100
0
50
40
0
0
60
0.97
22659453--22659477
9
2.8
9
100
0
50
36
0
0
64
0.94
22660364--22660406
11
4.0
11
84
6
61
20
46
4
27
1.71
22660363--22660405
21
2.0
21
90
4
68
20
46
2
30
1.63
22660893--22661442
226
2.4
226
99
0
1082
31
17
12
38
1.86
22661583--22661643
17
3.6
17
77
16
56
63
1
0
34
1.04
22664059--22664109
18
2.8
18
87
0
75
50
3
19
25
1.64
22665138--22665189
25
2.0
26
88
3
79
55
1
5
36
1.35
22667244--22667296
24
2.2
24
89
0
79
45
13
28
13
1.80
22668917--22668991
39
2.0
37
84
10
98
62
1
1
34
1.12
22670981--22671005
13
1.9
13
100
0
50
0
8
0
92
0.40
22671823--22671847
12
2.1
12
100
0
50
8
0
32
60
1.26
22673713--22673795
32
2.6
31
76
1
85
36
10
20
32
1.87
22674731--22674755
13
1.9
13
100
0
50
40
0
4
56
1.18
22674801--22674827
5
5.4
5
100
0
54
18
0
0
81
0.69
22675004--22675047
21
2.0
22
82
4
54
56
4
2
36
1.32
22675440--22675471
13
2.5
13
94
0
55
65
0
3
31
1.08
22675496--22675542
22
2.2
21
88
3
67
48
0
2
48
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22686381--22686453
26
2.8
26
87
2
112
15
26
24
34
1.94
22689256--22689615
137
2.6
138
80
10
366
25
10
11
52
1.69
22689766--22689825
25
2.3
26
78
16
63
46
0
0
53
1.00
22694432--22694468
18
2.1
18
94
0
65
32
5
18
43
1.73
22700695--22700745
26
2.0
25
88
7
77
41
1
0
56
1.10
22700700--22700751
26
2.2
23
83
13
61
48
1
0
50
1.12
22701715--22701741
8
3.4
8
100
0
54
55
0
0
44
0.99
22712238--22712277
17
2.3
18
86
4
55
20
5
22
52
1.65
22725093--22725121
9
3.3
9
90
9
51
0
10
0
89
0.48
22732755--22732936
27
6.7
27
74
7
136
17
25
19
37
1.93
22732776--22732930
54
2.9
55
73
3
154
16
25
18
39
1.91
22732726--22732930
108
1.9
108
81
4
252
17
25
18
38
1.92
22735479--22735512
17
1.9
18
94
5
61
29
2
0
67
1.05
22735557--22735636
31
2.6
29
81
15
81
61
7
1
30
1.31
22737557--22737981
104
4.1
104
91
0
663
31
11
16
40
1.83
22749160--22749250
45
2.0
45
85
2
121
37
28
6
27
1.82
22749231--22749298
16
4.2
16
96
0
127
38
35
0
26
1.57
22749419--22749465
15
3.1
15
81
6
51
44
2
2
51
1.25
22758648--22758672
12
2.1
12
100
0
50
24
44
16
16
1.86
22760353--22760389
17
2.2
18
85
9
51
8
24
0
67
1.17
22761256--22761438
91
2.0
91
95
0
330
32
16
10
39
1.83
22763814--22763860
23
2.0
23
87
0
67
55
19
4
21
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22766441--22766478
12
3.2
12
96
0
67
23
7
57
10
1.58
22766439--22766492
24
2.2
24
77
6
56
24
9
53
12
1.68
22767036--22767061
3
8.7
3
100
0
52
30
0
0
69
0.89
22771109--22771141
6
5.5
6
100
0
66
18
0
51
30
1.46
22771153--22771190
6
6.3
6
100
0
76
18
0
31
50
1.47
22774478--22774709
49
4.7
49
83
3
302
28
28
18
24
1.98
22774478--22774709
100
2.3
99
85
2
313
28
28
18
24
1.98
22778173--22778446
94
2.9
95
81
8
324
28
20
28
22
1.99
22778176--22778446
47
5.7
49
75
11
251
28
20
28
22
1.99
22779307--22779399
42
2.2
42
94
0
168
18
20
32
29
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356