Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  77  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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13
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1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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76
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
A
C
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(0-2)
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190
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2.1
39
93
4
139
19
21
31
26
1.97
24337594--24337641
18
2.7
18
96
0
87
35
12
12
39
1.81
24338069--24338405
72
4.7
72
85
2
428
24
5
15
54
1.63
24338080--24338351
145
1.9
144
89
2
420
22
5
16
55
1.62
24351769--24351809
16
2.6
16
85
11
50
24
29
7
39
1.82
24359798--24359943
20
7.3
20
72
9
91
38
17
6
38
1.74
24359852--24359939
40
2.2
40
83
4
106
39
17
4
38
1.70
24359885--24359950
20
3.3
20
86
0
87
37
21
4
36
1.74
24360119--24360183
22
3.0
22
84
10
80
35
18
21
24
1.96
24360106--24360229
47
2.7
45
72
17
112
33
16
21
27
1.95
24366255--24366384
55
2.4
55
81
2
145
27
31
24
16
1.96
24376380--24376474
44
2.2
44
96
0
181
28
12
17
41
1.86
24376468--24376499
13
2.3
15
89
10
50
18
34
9
37
1.83
24380930--24382276
696
1.9
695
92
1
2288
31
13
18
36
1.89
24392630--24392654
13
1.9
13
100
0
50
48
0
16
36
1.46
24414445--24414469
13
1.9
13
100
0
50
32
24
12
32
1.91
24433795--24433831
18
2.1
18
94
0
65
37
45
2
13
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24433855--24433895
6
6.5
6
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10
55
78
4
0
17
0.93
24433858--24433896
20
2.0
20
89
0
60
76
5
0
17
0.96
24433916--24433983
9
7.6
9
83
0
82
27
7
19
45
1.76
24434734--24434758
13
1.9
13
100
0
50
64
20
8
8
1.46
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185
2.0
185
99
0
723
39
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14
31
1.87
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5
5.8
5
100
0
58
82
0
0
17
0.66
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20
2.0
20
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0
73
41
19
4
34
1.73
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23
2.3
24
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3
65
44
18
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20
1.87
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24
3.6
24
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3
82
44
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16
21
1.86
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19
2.5
20
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9
66
71
2
2
24
1.07
24461597--24461638
18
2.4
18
84
4
59
11
21
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19
1.81
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16
2.1
16
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0
50
58
2
0
38
1.13
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17
2.0
17
88
0
50
76
8
2
11
1.12
24468025--24468310
44
6.5
42
75
5
230
26
23
21
29
1.99
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87
2.9
87
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1
392
24
23
21
30
1.99
24491603--24491669
28
2.5
26
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11
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2
4
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1.36
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3
100
0
106
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0
32
0
0.91
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3.7
43
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8
137
30
26
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25
1.97
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9
3.6
9
91
8
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64
0
0
35
0.94
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56
2.2
55
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7
156
51
4
1
42
1.33
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9
7.2
9
77
12
69
65
3
0
31
1.09
24508622--24508655
17
2.0
17
100
0
68
70
0
0
29
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24508757--24508799
21
2.0
22
86
4
61
4
11
48
34
1.60
24509067--24509103
18
2.1
18
94
0
65
40
8
27
24
1.83
24511231--24511291
31
2.0
31
100
0
122
36
13
11
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9
6.8
9
92
0
86
22
9
26
40
1.85
24514446--24514506
18
3.4
18
90
0
95
22
9
26
40
1.85
24514667--24514691
12
2.1
12
100
0
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11
90
0
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0
0
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0
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1.62
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34
0
0
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0.93
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30
2.0
31
90
3
95
53
13
5
28
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356