Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  277  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
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Score
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66
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Period
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.5
33
82
3
105
26
28
28
15
1.96
90755098--90755167
33
2.1
34
89
7
108
21
24
22
31
1.98
90755685--90755747
33
1.9
33
96
0
117
34
22
17
25
1.95
90768546--90768588
22
2.0
22
90
4
70
32
18
30
18
1.95
90770826--90770889
32
2.0
32
96
0
119
31
6
20
42
1.77
90773156--90773300
40
3.6
40
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8
159
27
24
24
23
2.00
90778438--90778517
37
2.2
37
86
4
108
27
31
17
23
1.97
90778648--90778898
47
5.4
47
87
2
328
26
32
9
31
1.89
90778648--90778929
141
2.0
140
81
8
326
27
31
9
31
1.88
90783488--90783632
40
3.6
40
84
4
184
26
24
24
24
2.00
90783488--90783663
40
4.4
40
80
2
115
26
24
24
25
2.00
90786182--90786366
79
2.3
82
83
7
229
24
27
22
24
2.00
90786163--90786366
40
5.1
40
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8
229
24
27
22
25
2.00
90793587--90793642
28
2.0
28
92
0
94
35
0
23
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1.55
90800409--90800633
40
5.7
40
90
5
307
25
21
27
26
1.99
90800409--90800666
120
2.2
119
82
8
294
26
20
27
25
1.99
90810765--90810828
32
2.0
32
100
0
128
34
18
18
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90813013--90813184
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3.8
45
92
1
274
22
23
26
26
2.00
90818195--90818258
32
2.0
32
100
0
128
34
18
18
28
1.95
90820492--90820671
45
4.0
45
84
4
202
23
22
26
27
1.99
90820495--90820671
90
2.0
90
84
2
230
23
22
26
28
1.99
90829408--90829450
18
2.4
18
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0
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30
18
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1.76
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77
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0
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14
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1.92
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22
2.0
22
100
0
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0
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17
2.0
17
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0
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2.0
17
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0
59
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0
5
1.26
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30
2.0
30
100
0
120
50
6
3
40
1.45
90868289--90868355
32
2.1
32
100
0
134
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2
11
38
1.56
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38
2.1
38
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0
149
24
3
18
53
1.61
90869994--90870043
26
1.9
26
91
0
82
42
2
10
46
1.49
90874855--90874901
21
2.2
21
84
3
58
46
12
2
38
1.54
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25
2.0
25
100
0
100
12
12
4
72
1.26
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50
3.8
50
80
6
195
27
17
24
30
1.98
90887273--90887455
101
1.8
100
87
7
271
27
18
24
30
1.98
90893115--90893142
14
2.0
14
100
0
56
42
14
28
14
1.84
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50
3.5
48
83
5
215
26
17
25
29
1.98
90894749--90894939
100
1.9
100
88
1
285
27
18
25
29
1.98
90897969--90898021
27
2.0
26
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3
70
33
15
13
37
1.86
90899466--90899503
8
4.8
8
87
12
60
86
0
2
10
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90899463--90899502
7
5.3
7
83
16
53
85
0
2
12
0.71
90899463--90899502
15
2.6
16
96
4
73
85
0
2
12
0.71
90904734--90904796
27
2.3
27
78
10
74
31
14
15
38
1.88
90913834--90913873
21
2.0
21
90
5
64
15
37
25
22
1.93
90920070--90920251
46
3.9
45
79
11
197
29
18
26
25
1.98
90920067--90920266
94
2.1
94
83
5
253
29
18
26
25
1.98
90924038--90924264
69
3.3
68
89
2
323
26
9
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90924038--90924300
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293
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9
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1.80
90924038--90924300
138
1.9
137
82
5
334
26
9
17
46
1.80
90925154--90925210
20
2.8
20
73
5
53
19
33
17
29
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356