Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  63  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20066063--20066103
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0
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2
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0
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24
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3.0
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29
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3.0
48
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0
232
28
23
9
38
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20122703--20122746
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1.9
23
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20123181--20123222
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2.8
15
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0
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1.48
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59
36
15
0
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1.45
20125095--20125132
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19
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2
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26
28
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2.1
18
100
0
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21
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1.71
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19
2.1
18
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51
23
0
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3
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1.9
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60
0
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2
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0
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2
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2
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20167775--20167801
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2.1
13
100
0
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7
58
1.50
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2.1
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0
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0
0
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8.2
142
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6
7
58
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2.0
22
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13
22
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1.85
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2.1
75
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2.3
16
90
4
58
63
5
26
5
1.37
20171983--20172022
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2.1
19
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55
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10
2
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1.08
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9
4.7
9
90
0
66
38
0
35
26
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20177801--20177854
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18
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1
1
70
1.07
20177797--20177860
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3.4
18
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29
1
1
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1.09
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2.0
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100
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1.90
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21
2.2
21
88
0
65
43
34
2
19
1.63
20184859--20184914
28
2.0
28
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6
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33
7
21
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1.81
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2.1
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90
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32
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1.92
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2.4
19
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72
77
6
9
6
1.13
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2
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6
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1.53
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27
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26
2.0
26
96
0
95
28
11
25
34
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20204223--20204692
234
2.0
234
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20
10
36
1.87
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21
2.7
23
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10
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33
1
1
63
1.14
20209158--20209323
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0
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9
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55
14
2
26
1.53
20213239--20213292
13
4.3
13
77
17
60
42
9
5
42
1.60
20213249--20213304
24
2.4
24
87
3
78
48
8
7
35
1.62
20215772--20215829
31
1.9
31
86
6
84
46
6
20
25
1.75
20216073--20216097
13
1.9
13
100
0
50
44
0
8
48
1.32
20220583--20220658
3
25.0
3
89
7
118
32
1
0
65
1.01
20220763--20220800
19
2.0
20
89
5
60
26
7
0
65
1.19
20220998--20221063
23
2.9
24
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13
86
30
1
6
62
1.29
20221238--20221286
13
3.8
12
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15
53
34
0
4
61
1.15
20221254--20221288
14
2.5
15
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13
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37
0
0
62
0.95
20221223--20221306
22
4.1
22
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20
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35
3
4
55
1.38
20221415--20221478
24
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25
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25
6
0
68
1.12
20233607--20234071
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74
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28
15
20
35
1.93
20234055--20234088
16
2.1
17
94
5
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17
8
5
67
1.37
20233999--20234251
88
2.8
90
85
5
368
28
16
18
36
1.93
20233978--20234314
88
3.8
87
80
10
360
28
15
17
38
1.91
20235929--20236068
11
12.6
11
65
21
53
30
7
1
60
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20235993--20236030
19
2.0
20
89
5
60
26
7
0
65
1.19
20236228--20236294
23
2.9
23
82
14
68
31
1
5
61
1.29
20236472--20236520
13
3.8
12
82
15
53
34
0
4
61
1.15
20236488--20236522
14
2.5
15
86
13
56
37
0
0
62
0.95
20236457--20236540
22
4.1
22
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20
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34
3
5
55
1.41
20236653--20236714
25
2.5
23
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24
6
0
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1.12
20238535--20238591
24
2.4
24
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2
80
45
8
5
40
1.58
20239244--20239311
33
2.1
33
100
0
136
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8
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33
1.81
20243635--20243671
2
18.5
2
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0
56
0
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2
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1.15
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5
5.6
5
100
0
56
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0
0
17
0.68
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35
3.6
35
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9
136
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25
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0
0
37
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2.9
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13
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62
0
0
37
0.95
20271196--20271242
23
2.0
23
83
4
58
61
4
2
31
1.27
20274665--20274701
18
2.1
18
94
0
65
64
2
2
29
1.21
20274917--20274959
23
2.0
23
86
9
63
34
6
0
58
1.25
20277243--20277398
15
10.1
14
68
18
71
61
0
6
31
1.26
20277307--20277402
17
5.5
17
75
15
79
61
0
5
33
1.18
20277264--20277403
10
14.6
10
66
25
54
62
0
5
31
1.24
20277307--20277403
37
2.6
38
82
11
119
61
0
5
32
1.18
20277309--20277461
65
2.4
65
78
12
154
60
1
5
32
1.30
20277447--20277505
21
2.8
22
73
19
54
62
3
5
28
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20277580--20277629
25
1.9
25
88
8
73
58
2
2
38
1.21
20280645--20280683
20
2.0
20
85
10
53
64
10
7
17
1.48
20282246--20282350
27
3.9
27
86
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133
35
22
23
18
1.96
20283970--20284077
26
4.2
26
92
0
171
37
24
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33
1.79
20289330--20289488
27
5.9
27
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10
182
36
22
22
18
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20289330--20289488
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3.0
54
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2
232
36
22
22
18
1.95
20289903--20289939
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4.6
8
89
0
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24
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26
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0
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20291220--20291244
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100
0
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1.69
20309440--20309491
16
3.4
16
73
10
54
34
1
5
57
1.33

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356