Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  18  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
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0
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2.0
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Period
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Number
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Percent
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Indels
Score
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18
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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25
1.96
6497593--6497673
15
5.5
15
83
1
101
60
13
16
9
1.58
6497593--6497677
45
1.9
44
85
2
116
58
16
15
9
1.61
6497587--6497682
15
6.4
15
75
10
72
59
14
15
10
1.61
6500888--6501076
47
3.9
47
81
8
175
30
28
15
25
1.96
6502649--6502681
14
2.4
14
90
10
50
72
9
9
9
1.28
6522249--6522323
37
2.0
37
97
0
141
53
9
24
13
1.68
6524729--6524867
59
2.4
59
92
0
224
37
13
17
30
1.89
6527653--6527680
13
2.2
13
100
0
56
39
35
7
17
1.78
6527988--6528104
48
2.5
48
90
1
182
46
18
11
23
1.81
6528235--6528299
12
5.4
12
81
0
76
61
7
7
23
1.49
6528242--6528299
18
3.2
18
78
9
64
62
8
6
22
1.48
6528235--6528299
24
2.7
24
87
0
94
61
7
7
23
1.49
6529200--6529254
27
2.0
27
100
0
110
38
10
10
40
1.76
6529523--6529564
10
4.6
9
83
13
50
38
2
2
57
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6533336--6533405
28
2.5
28
86
9
90
31
25
14
28
1.95
6538115--6538144
3
10.0
3
100
0
60
33
0
0
66
0.92
6538348--6538410
26
2.5
26
86
2
83
33
7
7
50
1.60
6538810--6538864
13
3.9
14
76
21
53
60
0
3
36
1.15
6542238--6542318
42
1.9
42
94
0
144
58
8
28
4
1.49
6543077--6543187
47
2.4
47
84
6
154
25
15
24
35
1.94
6551201--6551275
21
3.4
23
82
12
95
13
21
26
38
1.90
6553462--6553572
47
2.4
47
86
6
163
26
15
23
35
1.94
6558412--6558449
6
6.3
6
93
0
58
18
21
18
42
1.90
6558418--6558460
18
2.4
18
84
0
50
20
23
13
41
1.88
6559199--6559281
42
2.0
41
97
2
157
19
21
4
54
1.63
6567925--6567984
23
2.5
24
82
10
70
60
1
0
38
1.07
6567925--6567981
24
2.4
24
85
8
73
61
1
0
36
1.07
6569657--6569689
11
2.8
12
90
9
50
69
3
0
27
1.03
6586261--6586285
13
1.9
13
100
0
50
32
8
20
40
1.81
6586225--6586288
26
2.5
26
73
0
65
37
6
18
37
1.76
6590309--6590382
23
3.3
22
70
9
60
41
0
4
54
1.19
6594866--6594899
6
5.7
6
89
0
50
17
20
17
44
1.87
6595041--6595093
18
3.0
17
78
15
54
35
9
13
41
1.76
6596741--6596794
21
2.7
19
83
8
63
61
0
0
38
0.96
6596743--6596806
21
3.1
20
75
18
51
60
0
0
39
0.97
6597478--6597502
7
3.6
7
100
0
50
28
16
0
56
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6597725--6597762
8
4.9
8
83
3
51
18
7
0
73
1.06
6600502--6600560
29
2.1
29
93
3
102
13
27
6
52
1.65
6604820--6605088
46
5.8
47
91
2
393
20
25
15
39
1.91
6607235--6607286
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
6608381--6608414
17
2.0
17
88
11
52
44
11
17
26
1.83
6609578--6609694
25
4.6
24
72
15
69
20
24
20
34
1.97
6613831--6613905
31
2.5
31
82
2
89
44
6
9
40
1.63
6614206--6614280
21
3.7
21
73
21
61
57
2
1
38
1.21
6614215--6614268
19
2.8
21
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16
55
62
0
0
37
0.95
6614688--6614723
19
1.9
19
88
5
56
27
0
2
69
1.02

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356