Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  248  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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72
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1.95
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Period
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Copy
Number
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Score
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1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.91
81597072--81597115
14
3.1
14
76
0
52
20
45
0
34
1.51
81597916--81597955
20
2.0
21
85
14
57
27
5
15
52
1.63
81605468--81605492
12
2.1
12
100
0
50
24
24
16
36
1.94
81607767--81607845
37
2.1
37
90
0
122
25
31
18
24
1.98
81607964--81608331
47
7.7
47
93
2
578
28
29
8
32
1.88
81607975--81608331
192
1.9
190
91
3
542
28
29
9
32
1.88
81613065--81613326
40
6.6
40
86
3
298
25
27
20
25
1.99
81620818--81620983
40
4.3
40
87
5
207
27
28
21
22
1.99
81620817--81620983
79
2.2
76
82
5
201
27
28
21
22
1.99
81620818--81621034
39
5.6
39
80
9
187
26
28
21
23
1.99
81628057--81628163
38
2.7
38
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8
144
27
28
22
22
1.99
81628057--81628185
41
3.3
37
84
7
150
26
28
22
22
1.99
81628060--81628237
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4.5
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10
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25
28
21
23
1.99
81631308--81631600
27
10.8
27
87
3
392
29
23
7
40
1.81
81631592--81631729
27
5.1
27
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4
163
37
22
9
30
1.86
81631630--81631755
54
2.3
54
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8
141
40
22
7
29
1.82
81631710--81631817
27
3.9
27
67
13
67
40
19
8
31
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81644251--81644434
40
4.6
40
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6
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23
20
27
28
1.99
81644251--81644431
80
2.3
81
85
7
237
23
20
27
28
1.99
81653157--81653305
42
3.5
42
83
3
183
30
16
23
29
1.96
81666312--81666341
13
2.3
13
94
0
51
46
0
3
50
1.18
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67
2.0
67
83
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48
1.74
81666504--81667233
84
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9
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31
11
12
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1.77
81666341--81666640
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1.9
154
79
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335
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1.76
81666812--81667254
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5.2
85
88
2
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10
11
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1.74
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5
5.0
5
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0
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0
20
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84
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0
559
32
10
11
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1.73
81666833--81667322
253
1.9
253
83
4
632
32
10
11
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1.74
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14
2.1
14
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0
51
43
0
0
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26
10.2
26
83
1
251
36
27
15
20
1.93
81680779--81681027
78
3.2
77
80
2
284
35
28
16
20
1.94
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21
2.2
20
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8
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51
31
0
17
1.46
81685495--81685690
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2.0
97
95
2
349
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1.83
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3
8.7
3
100
0
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0
0
34
0.93
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3.8
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11
167
21
19
28
30
1.98
81691922--81692094
93
1.9
93
90
2
276
21
20
29
28
1.98
81709051--81709224
49
3.6
49
76
11
171
25
29
20
24
1.99
81709054--81709176
47
2.6
47
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131
26
30
20
22
1.98
81709196--81709364
46
3.6
45
80
9
164
24
28
18
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81712600--81713029
47
9.1
47
96
0
734
31
10
30
28
1.90
81713192--81713270
37
2.1
37
88
0
113
24
18
30
26
1.98
81735190--81735232
22
2.0
20
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41
20
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1.86
81743085--81743190
28
3.8
28
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1
122
24
17
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24
1.97
81743493--81743831
27
12.7
27
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35
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1.90
81743692--81743857
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2.0
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2
208
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1.90
81749901--81750302
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29
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1
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29
1.87
81749878--81750108
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4.9
47
95
2
408
32
8
29
29
1.87
81750079--81750140
31
2.0
31
100
0
124
32
6
32
29
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356