Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  242  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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21
16
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1.93
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2.3
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26
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3.3
22
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11
34
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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32
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3.0
21
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33
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28
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100
0
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45
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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3.2
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26
15
28
1.96
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60
6
17
4
71
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79688107--79688131
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0
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10
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1.96
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2.4
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83
8
114
9
8
42
38
1.69
79716070--79716127
27
2.1
27
81
12
66
50
10
22
17
1.76
79716289--79716370
39
2.1
40
90
2
130
50
14
10
24
1.75
79721621--79721843
39
5.7
40
85
8
266
25
22
27
24
2.00
79721621--79721843
79
2.8
81
84
9
282
25
22
27
24
2.00
79721621--79721876
79
3.3
79
81
10
217
26
21
27
24
1.99
79729660--79729869
39
5.3
39
90
2
307
25
21
27
25
1.99
79729609--79729888
39
7.1
39
81
10
204
26
21
27
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1.99
79740678--79740705
11
2.5
11
100
0
56
39
14
0
46
1.44
79742064--79742143
42
1.9
42
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5
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27
12
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1.91
79751963--79752040
24
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24
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3
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16
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14
42
1.86
79760928--79760989
31
2.0
31
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0
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0
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0
0
17
0.66
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13
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3
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75
0
7
17
1.02
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40
4.1
40
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6
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23
23
27
26
2.00
79765296--79765459
79
2.1
80
85
7
219
23
23
27
26
2.00
79767108--79767277
40
4.3
39
87
3
216
24
21
28
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79767055--79767277
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2.8
79
82
4
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25
21
28
24
1.99
79767131--79767312
79
2.3
80
83
1
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26
20
28
24
1.99
79775004--79775176
39
4.4
39
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7
199
26
20
28
24
1.99
79775010--79775178
79
2.2
77
84
4
223
24
20
29
24
1.99
79775033--79775211
77
2.3
79
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3
202
26
20
29
24
1.99
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3.7
46
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1.98
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1.8
93
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0
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1.98
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2.0
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0
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53
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0
0
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1.97
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1.96
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1.97
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42
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12
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10.0
5
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2
0
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1.07
79826998--79827042
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5.0
9
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33
2
0
64
1.06
79826997--79827047
14
3.7
14
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5
68
33
3
0
62
1.13
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19
2.0
19
100
0
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59
2.1
59
93
0
208
48
0
13
37
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79837916--79838045
59
2.2
59
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2
190
49
1
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1.49
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14
2.3
15
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50
78
0
12
9
0.95
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25
2.0
25
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0
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2.0
73
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0
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14
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1.99
79854855--79854933
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28
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0
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1.97
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33
22
24
20
1.97
79861918--79862049
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2.6
47
76
17
124
51
29
0
18
1.51

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356