Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  66  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Score
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1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
C
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(0-2)
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0
56
0
25
0
75
0.81
21143459--21143492
9
3.9
9
84
7
52
2
17
0
79
0.86
21143459--21143492
17
2.0
17
94
0
59
2
17
0
79
0.86
21143501--21143573
5
14.6
5
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20
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54
4
1
39
1.28
21143502--21143544
19
2.3
19
92
8
70
55
0
2
41
1.12
21143508--21143572
24
2.7
24
80
9
69
56
4
1
36
1.29
21148625--21148732
44
2.4
44
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3
144
29
23
13
33
1.93
21149615--21149642
4
7.0
4
100
0
56
0
25
0
75
0.81
21149702--21149735
9
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9
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52
2
17
0
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21149702--21149735
17
2.0
17
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2
17
0
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5
13.8
5
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20
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4
1
38
1.29
21149744--21149785
19
2.2
19
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2
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1.13
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24
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21
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22
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2
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23
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18
2.2
18
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0
51
12
23
2
61
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21155169--21155228
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2.7
23
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19
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6
0
26
1.16
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4
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4
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9
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2
0
23
0.97
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10
6.0
10
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11
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1
8
21
1.25
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29
2.3
30
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14
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1.60
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2
0
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1
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58
0
0
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13
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1.75
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2.1
39
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0
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20
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27
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2.1
118
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0
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38
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7
38
1.76
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2.7
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23
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23
6
6
64
1.39
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1.29
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29
8
0
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1.25
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25
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2.4
17
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1.63
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3
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2
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1.27
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21
2.2
22
79
17
57
38
0
0
61
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21215914--21215960
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2.9
16
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12
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1.48
21220476--21220522
16
2.9
16
78
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51
61
12
21
4
1.48
21225289--21225387
50
1.9
52
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4
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33
13
13
40
1.83
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50
2.3
50
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2
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32
13
13
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1.9
25
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0
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18
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19
3.0
19
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20
57
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1
1
29
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356