Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  72  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
2.0
25
92
0
84
39
5
17
37
1.74
22794986--22795033
12
3.9
12
75
5
51
39
4
18
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1.70
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100
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18
100
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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17
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36
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.88
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2.7
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106
37
12
20
29
1.90
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1.9
17
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0
39
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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197
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56
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13
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0
151
47
6
19
26
1.72
22931326--22931372
23
2.0
23
100
0
94
6
17
25
51
1.69
22932852--22932889
3
13.3
3
83
10
53
63
0
36
0
0.95
22949870--22950074
65
3.2
63
79
10
209
34
7
15
42
1.76
22949917--22950074
63
2.5
62
83
11
196
32
10
16
41
1.82
22950257--22950416
82
2.0
82
98
0
311
29
20
27
23
1.98
22950257--22950422
41
4.0
41
92
0
269
29
20
27
22
1.99
22952410--22952643
121
2.0
118
86
5
328
29
5
8
56
1.51
22954441--22954530
33
2.7
33
77
0
90
28
37
8
24
1.86
22954500--22954562
32
2.0
32
84
6
83
20
41
15
22
1.90
22956282--22956319
20
1.9
20
88
0
58
31
0
15
52
1.43
22956758--22956805
19
2.6
18
83
3
51
68
2
27
2
1.11
22960599--22960631
17
1.9
17
93
0
57
42
45
3
9
1.51
22960719--22960786
9
7.6
9
86
0
73
26
8
22
42
1.82
22960719--22960786
18
3.8
18
86
7
93
26
8
22
42
1.82
22960719--22960787
27
2.6
27
81
4
86
26
8
21
43
1.81
22961679--22961735
27
2.1
27
90
6
89
15
42
17
24
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22968189--22968260
20
3.7
20
83
7
85
58
6
1
33
1.33
22968239--22968288
24
2.0
24
84
7
64
56
2
0
42
1.11
22969251--22969568
3
106.7
3
74
8
220
60
0
8
31
1.31
22969389--22969467
22
3.5
23
72
16
67
59
1
6
32
1.31
22969567--22969597
3
10.3
3
100
0
62
35
0
32
32
1.58
22971120--22971254
49
2.7
49
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4
191
28
23
13
34
1.93
22971281--22971439
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1.8
86
85
5
223
27
20
20
30
1.98
22971231--22971569
130
2.6
131
83
5
420
29
22
17
30
1.97
22971410--22971611
86
2.4
85
85
3
271
31
20
16
31
1.95
22971414--22971655
86
2.8
84
81
5
270
30
19
17
32
1.95
22971279--22971741
216
2.1
216
92
0
766
29
19
18
32
1.96
22971179--22971970
44
17.8
44
70
9
410
28
21
18
31
1.97
22971493--22971840
130
2.6
132
82
6
425
29
20
18
31
1.96
22971753--22971970
89
2.4
89
78
4
235
26
24
20
28
1.99
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2.6
82
84
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249
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25
1.67
22976496--22976670
90
2.0
89
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253
54
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24
1.64
22984026--22984292
3
89.3
3
72
6
139
57
1
10
31
1.39
22984308--22984340
3
11.0
3
100
0
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33
0
33
33
1.58
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5.2
9
81
2
58
56
0
0
43
0.99
22995485--22995519
18
1.9
18
100
0
70
60
0
0
40
0.97
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24
2.0
23
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4
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52
0
2
45
1.13
23005609--23005666
30
1.9
30
82
6
73
51
0
1
46
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23005622--23005671
15
3.3
15
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0
55
48
0
0
52
1.00
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2.0
62
93
0
214
40
8
8
42
1.65
23012277--23012305
12
2.5
12
94
5
51
0
13
0
86
0.58
23013402--23013485
42
2.0
42
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0
159
25
9
17
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1.78
23026431--23026564
48
2.8
48
87
0
169
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15
39
13
1.86
23027264--23027303
21
1.9
21
94
0
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27
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23027749--23027803
18
3.1
18
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10
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20
7
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1.56
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2.0
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0
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29
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1.88
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15
2.0
15
100
0
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6
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40
1.71
23028366--23028399
15
2.3
15
89
0
50
14
11
35
38
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356