Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  19  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6614981--6615028
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1.9
25
100
0
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0
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1.60
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2.0
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10
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19
2.8
20
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1
1
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1.22
6646980--6647034
25
2.2
25
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60
27
3
1
67
1.17
6647062--6647097
19
1.9
19
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0
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58
100
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27
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2.0
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0
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10
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2
0
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2.0
21
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2
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1.23
6660449--6660500
20
2.5
21
76
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1
3
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1.16
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25
2.3
25
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0
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27
2.6
27
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43
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2
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1.66
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5.0
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3
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23
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20
2.5
21
84
15
72
56
3
0
39
1.18
6671776--6671826
19
2.7
19
88
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70
56
3
0
39
1.18
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2.5
23
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10
1
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1.46
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34
2.4
34
93
2
135
47
12
8
31
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6676630--6676805
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3.8
47
78
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20
19
28
30
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6676627--6676797
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1.8
93
91
2
281
20
20
29
29
1.98
6680356--6680461
37
2.8
37
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169
28
17
16
36
1.93
6680428--6680725
52
5.9
52
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7
404
29
22
14
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1.93
6680513--6680731
46
4.7
46
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280
29
22
13
34
1.93
6680410--6680731
98
3.3
97
84
10
429
28
22
13
34
1.93
6689173--6689229
13
4.6
13
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12
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38
47
0
14
1.44
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3.0
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401
23
4
10
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3.1
37
62
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89
25
3
11
59
1.48
6692943--6693006
20
3.3
20
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45
1.71
6692921--6693021
37
2.7
37
93
0
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4
14
47
1.66
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9
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0
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40
0
3
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1.18
6699980--6700005
10
2.6
10
100
0
52
42
15
19
23
1.89
6700220--6700269
21
2.3
21
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82
46
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22
1.74
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0
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2
0
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100
0
66
66
0
0
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10
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31
7
0
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1.9
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6
86
33
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10
48
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12
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43
0
1
55
1.10
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8
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9
74
21
61
43
0
1
55
1.10
6716891--6716946
12
4.5
12
81
16
69
42
0
1
55
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6718263--6718301
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2.1
19
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4
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41
0
10
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1.37
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3.4
39
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112
23
20
28
28
1.99
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1.9
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2
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17
21
27
1.95
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23
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19
80
22
10
0
65
1.28
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3.0
23
84
12
81
20
10
1
68
1.27
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2.5
36
92
7
144
21
6
0
71
1.09
6720632--6720733
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2.9
37
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151
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8
0
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1.18
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20
21
0
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1.41
6720926--6721035
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20.4
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21
0
57
1.41
6720926--6721034
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16
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11
80
21
22
0
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1.42
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1
0
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11
2
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1.43
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27
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13
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26
13
1
58
1.42
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27
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23
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14
1
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376
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13
1
58
1.45
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1.9
153
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393
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15
1
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1.48
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12
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1.49
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10
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2.1
20
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5
0
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1.19
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2.0
48
95
0
174
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13
7
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1.72
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22
2.0
21
86
8
61
18
9
6
65
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6728362--6728421
27
2.1
30
82
14
74
55
6
5
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1.48
6728724--6728770
3
15.7
3
95
0
85
63
0
2
34
1.06
6729651--6729718
26
2.6
26
95
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118
16
27
0
55
1.41
6730353--6730448
34
2.8
35
87
3
140
26
11
46
15
1.79
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43
73
14
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21
18
30
1.97
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111
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20
17
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22
2.2
22
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0
71
61
8
10
20
1.53
6745132--6745190
22
2.7
22
78
5
57
62
6
11
18
1.50
6751609--6751655
22
2.1
22
88
0
67
51
8
27
12
1.69
6754715--6754835
59
2.1
59
100
0
242
33
23
4
38
1.76
6761707--6761924
118
1.8
119
79
4
253
36
12
23
27
1.91
6766584--6766647
30
2.2
30
88
2
94
53
7
3
35
1.46
6772819--6772869
25
2.0
25
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0
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39
5
17
37
1.74
6772822--6772869
12
3.9
12
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5
51
39
4
18
37
1.70
6773980--6774035
28
2.0
28
100
0
112
25
7
32
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1.83
6777518--6777568
25
2.0
25
92
0
84
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5
17
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1.74
6777521--6777568
12
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12
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1.70
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40
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0
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14
2
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78
1.03
6784652--6784696
16
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16
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80
0.97
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2.3
22
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30
1
1
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1.14
6799204--6799278
16
4.4
17
76
14
64
42
1
0
56
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
17
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50
0
0
50
1.00
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8
5.2
9
80
12
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41
2
0
56
1.11
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22
2.0
22
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4
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27
9
9
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1.62
6801345--6801385
19
2.2
19
86
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34
0
2
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1.08
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0
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14
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1.63
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12
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3
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0
0
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2.1
17
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0
5
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1.05
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0
1
49
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51
0
2
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1.14
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0
1
50
1.08
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0
0
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1.00
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0
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0
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30
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39
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6
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20
23
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51
0
2
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1.14
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1.08
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0
0
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1.00
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3
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0
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0
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0
30
30
1.57
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39
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6
108
20
23
28
27
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18
5.2
18
86
0
132
32
15
23
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6821136--6821228
36
2.6
37
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6
147
32
15
23
29
1.95
6829048--6829106
29
2.0
30
86
3
84
32
8
1
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1.39
6829056--6829128
26
2.8
25
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18
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34
5
1
58
1.29
6829086--6829139
26
2.1
26
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35
3
1
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1.9
21
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10
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1.68
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3.1
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0
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0
0
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0
0
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0.99
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15
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1.91
6837499--6837700
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2.7
75
93
1
343
27
18
20
33
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356